当前解析结果
SmilChr03G001761| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001761 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001761 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001761 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 24029177 - 24030433 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018550 |
|---|---|
| GeneID | 131018550 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018550 |
| 原始查询 | SmilChr03G001761 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=27.4; qcov=0.481; evalue=5.74e-12; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018550 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803247.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057803247.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057803247.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057803247.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803247.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:24029255 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 47 | A13,A14,A20,A25,A5,B1,B106,B108,B111,B112,B12,B123,B124,B128,B135,B139,B14,B2,B22,B25,B3,B34,B38,B42,B45,B57,B58,B6,B66,B68,B69,B93,B99,C19,C25,C26,C41,C54,C65,C68,C77,C78,C8,C80,C83,D1,D9 |
Chr3:24029276 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B41,C65 |
Chr3:24029314 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A7 |
Chr3:24029330 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B105 |
Chr3:24029353 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B27 |
Chr3:24029358 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B105 |
Chr3:24029389 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B37 |
Chr3:24029389 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B37 |
Chr3:24029390 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | B11,B18,B23,B73,B77,C10,C18,C3,C30 |
Chr3:24029398 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C59 |
Chr3:24029411 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B15,C48,C79,C9 |
Chr3:24029413 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。