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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001766`

染色体: Chr03 坐标: 24094906-24096810 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001766`
名称	SmilChr03G001766
描述	uncharacterized SmilChr03G001766
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24094906 - 24096810 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018553`
GeneID	`131018553`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018553`
原始查询	`SmilChr03G001766`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=46; qcov=0.4; evalue=7.86e-26; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=54.3; qcov=0.924; evalue=1.76e-117; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803251.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803251.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803251.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803251.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803251.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24094980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A11,A19,A20,A23,B118,B17,B21,B24,B26,B40,B77,B90,B92,C28,C4,C53,C58,C74,C80,D3,D5
`Chr3:24096292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B114,B3,C10
`Chr3:24096292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B3,C10
`Chr3:24096320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B48
`Chr3:24096339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr3:24096370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C87
`Chr3:24096370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:24096391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A19,B130
`Chr3:24096391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B130
`Chr3:24096392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C33,C75
`Chr3:24096392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C75
`Chr3:24096406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B107,B68,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803251.1

315 aa

158

315

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 1-35 aa PF04827 Plant_tran 104-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803251.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	1	35	2.9e-17	62.8	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057803251.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	104	291	1.7e-87	293.0	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947268.1
ATGAGTGACTATTTTGTCCCTAATCCAACGTATACTTCGGAGCTCTTCCGGCGTAGATTTCACATGCAGAAATCATTGTTCCTTCGTATAGTGGATGTTGTTACTGCTAATGACAAATATTTTCAACAGAGACCCGATTGCACGGGCAGGCAAGGCCTTTCACCACTACAAAAATGCACTAGAGCTATGAGGGTGTTGGCTTATGGAACCGCAACCGATGCCGTTGATGAATACTTACGGATGAGTTCAACAGTCATGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018553
ATGAGTGACTATTTTGTCCCTAATCCAACGTATACTTCGGAGCTCTTCCGGCGTAGATTTCACATGCAGAAATCATTGTTCCTTCGTATAGTGGATGTTGTTACTGCTAATGACAAATATTTTCAACAGAGACCCGATTGCACGGGCAGGCAAGGCCTTTCACCACTACAAAAATGCACTAGAGCTATGAGGGTGTTGGCTTATGGAACCGCAACCGATGCCGTTGATGAATACTTACGGATGAGTTCAACAGTCATGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803251.1
MSDYFVPNPTYTSELFRRRFHMQKSLFLRIVDVVTANDKYFQQRPDCTGRQGLSPLQKCTRAMRVLAYGTATDAVDEYLRMSSTVMRDVVIHFVEGIISYFGDTYLRRPNQQDFQRLLYVGEQRGFPSMIGSIDCMHWEWKNCPTAWAGQYARRSGKPTIILEAVASYDLWIWHAFFGTPGSCNDINVLHRSPVFSDILEGRSPNISYVVNGRQNDRAYYLTDGICPSWAAFVKTISSPVLRKHKLFPQHQEAVRKNVDR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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