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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001769`

染色体: Chr03 坐标: 24163457-24169067 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001769`
名称	SmilChr03G001769
描述	dynamin-related protein 4C-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24163457 - 24169067 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018556`
GeneID	`131018556`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018556`
原始查询	`SmilChr03G001769`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dynamin-related protein 4C-like
产物	dynamin-related protein 4C-like
Arabidopsis	`AT1G60500` (DRP4C) Dynamin related protein 4C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842345] identity=63.6; qcov=0.754; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0260000` - identity=59.1; qcov=0.787; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005874 (microtubule); GO:0008017 (microtubule binding); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00350 (Dynamin_N); PF01031 (Dynamin_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018556

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057803254.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803254.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057803254.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803254.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803254.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24163609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B17,B76
`Chr3:24163647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B91,C47,D6
`Chr3:24163648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B22,C42
`Chr3:24163656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B22,C42
`Chr3:24163665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C24
`Chr3:24163695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr3:24163756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr3:24163801`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	48	A13,A18,B1,B104,B107,B11,B111,B118,B120,B2,B27,B28,B29,B30,B33,B35,B38,B39,B44,B56,B58,B6,B71,B74,B78,B79,B91,B96,C1,C24,C25,C32,C33,C38,C39,C40,C43,C44,C46,C47,C5,C52,C68,C71,C79,C82,D6,D9
`Chr3:24163960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr3:24163972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,C42,C5,D9
`Chr3:24163975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B27,B38,B49
`Chr3:24163977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803254.1

675 aa

338

675

Dynamin_N

Dynamin_M

PF00350 Dynamin_N 81-255 aa PF01031 Dynamin_M 263-547 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803254.1`	Pfam	`PF00350`	Dynamin_N	Domain	81	255	9.7e-41	140.3	Dynamin family
`XP_057803254.1`	Pfam	`PF01031`	Dynamin_M	Family	263	547	2e-60	205.1	Dynamin central region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947271.1
AGACGAAGGCCTTAAAAAGCAGTTGCCTATCAGCAAACTTCTCCATTCCACATGAAATGTCATCATCTACATTAGTAGAGCCATTGCCCTCGATGAAGATACGCGAACACCATCGCCAACAAGAACCAGACGAATCTAAGCAAAGTTTGGCTCTGGTAAGCATCAATGGTGGTGGTGGAACAGCCTCCTCCGCCCCGCTCGTGTCGTCGTACAACGACAGGATCCGCCCACTGATCGACGCCGTGGACAGGCTGCGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018556
ATGTCATCATCTACATTAGTAGAGCCATTGCCCTCGATGAAGATACGCGAACACCATCGCCAACAAGAACCAGACGAATCTAAGCAAAGTTTGGCTCTGGTAAGCATCAATGGTGGTGGTGGAACAGCCTCCTCCGCCCCGCTCGTGTCGTCGTACAACGACAGGATCCGCCCACTGATCGACGCCGTGGACAGGCTGCGCCACCTTAAAATCATGCAGGAAGGCATCCAGCTCCCGACCATCGTCGTCGTCGGCGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803254.1
MSSSTLVEPLPSMKIREHHRQQEPDESKQSLALVSINGGGGTASSAPLVSSYNDRIRPLIDAVDRLRHLKIMQEGIQLPTIVVVGDQSSGKSSVLESLAGISLPRGQGICTRVPLIMRLQNHQNPQPELSLEFNGKVVPTDEDHIAHAIVVATDEIAGQGKGISNHPLTLVVKKRGVPDLTMVDLPGITRVPVHGQPEDIYEQVSGIIMEYITPEESIILNVLSASVDFSTCESIRISQRVDKTGQRTLAVVTKADRSPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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