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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001772`

染色体: Chr03 坐标: 24176355-24177375 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001772`
名称	SmilChr03G001772
描述	uncharacterized SmilChr03G001772
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24176355 - 24177375 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015682`
GeneID	`131015682`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015682`
原始查询	`SmilChr03G001772`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G33406` (AT5G33406) hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333] identity=29.2; qcov=0.786; evalue=4.76e-28; confidence=low
Rice	`Os06g0658400` - identity=53.7; qcov=0.958; evalue=1.95e-98; confidence=high
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015682

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800087.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800087.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800087.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800087.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800087.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24176436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C50,C8
`Chr3:24176627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr3:24176638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr3:24176691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr3:24176767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B119,C10,C74
`Chr3:24176836`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A13,A14,A24,B55,B61,B78,B90,B92,C18,C26,C43,C48,C63,C79,C83,D7
`Chr3:24176863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr3:24176892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B14,B46
`Chr3:24176913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C1
`Chr3:24176949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A13,A14,A18,B10,B109,B15,B48,B55,B57,B61,B62,B78,C18,C19,C21,C24,C25,C26,C35,C48,C71,C79,C81,C83,D5,D7
`Chr3:24177015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A6,B35,B45,B63,B77,B97,C11,C23,C53,C69,C84,C86
`Chr3:24177133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800087.1

309 aa

154

309

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 167-246 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800087.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	167	246	1.6e-10	41.3	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944104.1
AATGGTCTATGTATCGTGAGGATAACATTGAGAAAGCTAGAATTGTGAAAGAAAAATTGTTAGATGATGGCTGGTGGGATTCAGTAGATTATATTCTTCGTTTTACTGAGCCGATTTATTCGATGTTGAGAATTTGTGATACGGATAAACCTTGTCTGCACTTGGTTTATGGGATGTGGGATACCATGATAGTTAAAGTGAAACGAGTTATCTTTGAGCATGAGATGAAGAGTGACTTAGAGGAATCCAGCTTTTGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015682
ATGTATCGTGAGGATAACATTGAGAAAGCTAGAATTGTGAAAGAAAAATTGTTAGATGATGGCTGGTGGGATTCAGTAGATTATATTCTTCGTTTTACTGAGCCGATTTATTCGATGTTGAGAATTTGTGATACGGATAAACCTTGTCTGCACTTGGTTTATGGGATGTGGGATACCATGATAGTTAAAGTGAAACGAGTTATCTTTGAGCATGAGATGAAGAGTGACTTAGAGGAATCCAGCTTTTGGAATGTTGTATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800087.1
MYREDNIEKARIVKEKLLDDGWWDSVDYILRFTEPIYSMLRICDTDKPCLHLVYGMWDTMIVKVKRVIFEHEMKSDLEESSFWNVVCNVLEDRWSKSNTQLHCLAHSLNPRCITEDWIKEHPYLQTPNHDADIVKMTKNCIKRLFPDAETRTAVTLEFANFFGCFEEFGDEDSIRDRLKLDPLKWWVAYGIGAPHLRPLAVRLLGQVSSSSCCERNWSTYSFIHSTKRNRITVERAEDLVYVHSNLRLLSRRAPQYMKGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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