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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001779`

染色体: Chr03 坐标: 24302957-24304005 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001779`
名称	SmilChr03G001779
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24302957 - 24304005 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018560`
GeneID	`131018560`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018560`
原始查询	`SmilChr03G001779`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=51.3; qcov=0.458; evalue=4.89e-35; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=52.6; qcov=0.984; evalue=4.68e-88; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018560

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803257.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057803257.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057803257.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803257.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803257.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24302972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr3:24302974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B90
`Chr3:24302981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B55
`Chr3:24302993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr3:24302995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,C67
`Chr3:24302997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B126,B36,C36,C47
`Chr3:24302998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C17,C59,D6
`Chr3:24303010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr3:24303014`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	B124,B140,B22,B31,B32,B49,B64,B74,B79,B87,C24,C55,C6,C60,D11,D8
`Chr3:24303021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A24,B107,B109,B11,B114,B117,B120,B121,B122,B126,B129,B18,B33,B36,B5,B53,B63,B70,B85,B94,C15,C19,C31,C36,C47,C52,C56,C65,C66,C86,D10
`Chr3:24303033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B9,D6
`Chr3:24303039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803257.1

251 aa

126

251

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 5-188 aa PF13359 DDE_Tnp_4 42-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803257.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	5	188	1.1e-87	293.7	Plant transposon protein
`XP_057803257.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	42	179	3.5e-10	40.5	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947274.1
ATGCACGAAGCGAAGCACGGCTTCCCGGGAATGCTAGGGAGCCTTGATTGCATGCATTGGCCGTGGAAGAATTGTCCAACGGCATGGCAAGGCGCATACACTCGCGGCGATCAGGGAGAACCGATCATCATCCTCGAAGCCGTCGCATCGCAAGATCTATGGATCTGGCATGCTTTTTTTGGGACTCCTGGTTCAAACAACGACATCAACGTGCTCAACAACTCGACGTTGTTCAACGATCGGCTGCAAGGAATGGGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018560
ATGCACGAAGCGAAGCACGGCTTCCCGGGAATGCTAGGGAGCCTTGATTGCATGCATTGGCCGTGGAAGAATTGTCCAACGGCATGGCAAGGCGCATACACTCGCGGCGATCAGGGAGAACCGATCATCATCCTCGAAGCCGTCGCATCGCAAGATCTATGGATCTGGCATGCTTTTTTTGGGACTCCTGGTTCAAACAACGACATCAACGTGCTCAACAACTCGACGTTGTTCAACGATCGGCTGCAAGGAATGGGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803257.1
MHEAKHGFPGMLGSLDCMHWPWKNCPTAWQGAYTRGDQGEPIIILEAVASQDLWIWHAFFGTPGSNNDINVLNNSTLFNDRLQGMGVPITYQVNNAYYTSGYYLTDGIYPNWPVFVKSPTHPTDPKGKRFKVMHEAARKDIERAFGILQARWAIVKGPSRLWSKEAMSDIMFTCIILHNMIIKDEGEHATQWEEDADEASSSAASQPRAGAPPDFCAFVARQASMRDAEMHARLTLDLKEHIWSHFNEADS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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