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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001799`

染色体: Chr03 坐标: 24605563-24609706 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001799`
名称	SmilChr03G001799
描述	3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase 3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24605563 - 24609706 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015706`
GeneID	`131015706`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015706`
原始查询	`SmilChr03G001799`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase 3, chloroplastic-like
产物	3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase 3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G24360` (AT1G24360) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839053] identity=76.7; qcov=0.573; evalue=1.42e-43; confidence=medium
Rice	`Os04g0376300` (OSJNBb0006N15.11) - identity=81.1; qcov=0.573; evalue=3.86e-46; confidence=medium
GO	-
KEGG	smil00061 (Fatty acid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00780 (Biotin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015706

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057800112.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057800112.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057800112.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800112.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800112.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24605762`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B131,B5,B57,C16,C28
`Chr3:24605762`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B131,B5,B57,C16,C28
`Chr3:24605968`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	48	A13,A18,A25,A4,A5,B100,B103,B107,B109,B110,B115,B137,B3,B30,B36,B37,B4,B44,B45,B5,B54,B62,B7,B71,B77,B8,B86,B99,C13,C17,C19,C21,C25,C26,C29,C3,C30,C34,C35,C43,C5,C58,C7,C75,C77,C78,C79,C85
`Chr3:24606428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr3:24606454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800112.1

157 aa

157

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 51-153 aa PF08659 KR 52-135 aa PF13561 adh_short_C2 56-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800112.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	51	153	5.3e-24	85.5	short chain dehydrogenase
`XP_057800112.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	52	135	1.1e-07	32.7	KR domain
`XP_057800112.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	56	136	3.1e-14	53.8	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944129.1
TTACTTCACAACAAAATTAATCCACACAGAAAATTGACTCCTAATCAAACCCAAGAAGATGAAGTGGCGCCGTTCTCACGCCTCTGTTCCCTGAAGCGCCGCCTCCGCCTCCTTCCGTTTGCCCGTCGGCGTGGGCGCGCCGCAGCCGCACAGCCCCCGTACCGTCTGCCGCCGACGCGCGATGACGCGGCGCGCCGCCTCCGCCTCATTCCCTTTGGCCGTCGAAGCCCCCTACCCTTTGCCCGTCCACGCGGCGGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015706
ATGTTCTCCGTCAGCCGCCGCTGCGGAGCTCCAACGCAAACAATGAAAGCTTTAGCTCAACAAAGAGATAAAAATATGAAGGTCCTTCAAGAGAAAATGAAGCTTAATGAGAAACAAGTAAAACGATTCAATCCTAAGGTAGAAGCTCCTGTTGTTGTTATCACTGGAGCTTCCAGAGGAATCGGCAAAGCTGTTGCTTTGGCTCTCGGGAAAGCTGGCTGCAAGATTTTAGTTAATTATGCAAGGTCATCAAGTGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800112.1
MFSVSRRCGAPTQTMKALAQQRDKNMKVLQEKMKLNEKQVKRFNPKVEAPVVVITGASRGIGKAVALALGKAGCKILVNYARSSSEAEEVGKEIEASGGQARTFGGDVSKEADVESIIKTAVDAWGTVDVLINNASSRIAEFLLVCVCSFNKVIKTF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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