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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001804`

染色体: Chr03 坐标: 24646199-24649746 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001804`
名称	SmilChr03G001804
描述	uncharacterized SmilChr03G001804
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24646199 - 24649746 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015705`
GeneID	`131015705`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015705`
原始查询	`SmilChr03G001804`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828432]; symbol=AT4G23330; hit=AT4G23330; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828432]; symbol=AT4G23330; hit=AT4G23330; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G23330` (AT4G23330) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828432] identity=68.5; qcov=0.667; evalue=3.54e-48; confidence=medium
Rice	`Os07g0483400` (OJ1136_F08.108) - identity=55; qcov=0.673; evalue=4.45e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10157 (BORCS6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057800110.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057800110.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057800111.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800111.1`
5	Autophagic vesicle	Autophagic vesicle	0.40000	`XP_057800111.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24646444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr3:24646686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B75,B9
`Chr3:24646866`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	147	A1,A10,A13,A14,A15,A19,A2,A20,A22,A23,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B101,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B112,B114,B117,B118,B121,B123,B126,B127,B129,B130,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B14,B16,B17,B2,B20,B21,B22,B23,B25,B26,B30,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B44,B45,B46,B47,B48,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B60,B63,B65,B66,B67,B68,B7,B71,B72,B75,B76,B78,B8,B82,B83,B84,B86,B88,B9,B90,B93,B94,C11,C12,C13,C17,C19,C2,C21,C23,C26,C28,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C4,C41,C44,C45,C47,C5,C51,C53,C54,C58,C59,C60,C62,C63,C67,C68,C69,C7,C74,C75,C76,C78,C8,C80,C81,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D2,D3,D4,D5,D7,D8
`Chr3:24646868`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B73,C46,C6
`Chr3:24646868`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B73,C46,C6
`Chr3:24649361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B48,D5
`Chr3:24649375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:24649401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr3:24649411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:24649510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800109.1

195 aa

195

BORCS6

PF10157 BORCS6 58-140 aa

XP_057800110.1

170 aa

170

BORCS6

PF10157 BORCS6 58-160 aa

XP_057800111.1

162 aa

162

BORCS6

PF10157 BORCS6 58-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800109.1`	Pfam	`PF10157`	BORCS6	Family	58	140	2.7e-18	66.7	BLOC-1-related complex sub-unit 6 C-terminal helix
`XP_057800110.1`	Pfam	`PF10157`	BORCS6	Family	58	160	7.9e-18	65.2	BLOC-1-related complex sub-unit 6 C-terminal helix
`XP_057800111.1`	Pfam	`PF10157`	BORCS6	Family	58	152	6e-22	78.4	BLOC-1-related complex sub-unit 6 C-terminal helix

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944128.1
TGAACTGAACCGTTTAGACTGGGTGATGAGTAATGGCGCAATTATTCCAGTTTATTCAATGCCGTGAAAGCAAGCAAGCCGAGTTTTAAAGCGCCAGTCTTTTCCTTTTCCTCTTTCGTCGCTCAAGCCTTTTCTATGGAGAACGAGGAAACGATTAACGACAAATCAGAGGCCGAAGTTTCGGATGCGGTGGTCGGTCATCATTTTCCTTGCCATTTCGACGGTGGCGGTGGCCAGGAAGATGCAAAATCTTATGGCGA...

XM_057944126.1
CGTTTAGACTGGGTGATGAGTAATGGCGCAATTATTCCAGTTTATTCAATGCCGTGAAAGCAAGCAAGCCGAGTTTTAAAGCGCCAGTCTTTTCCTTTTCCTCTTTCGTCGCTCAAGCCTTTTCTATGGAGAACGAGGAAACGATTAACGACAAATCAGAGGCCGAAGTTTCGGATGCGGTGGTCGGTCATCATTTTCCTTGCCATTTCGACGGTGGCGGTGGCCAGGAAGATGCAAAATCTTATGGCGATGAGTTGGCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131015705
ATGGAGAACGAGGAAACGATTAACGACAAATCAGAGGCCGAAGTTTCGGATGCGGTGGTCGGTCATCATTTTCCTTGCCATTTCGACGGTGGCGGTGGCCAGGAAGATGCAAAATCTTATGGCGATGAGTTGGCTGTGCCGGAGCCGCTCGGTCGGAGGAAAGATATTCTGAAAGCTCTGGAGGCAGTGGAGAGAGATTCGGCTGCCATCGCTGAGAGCTTCTCCTCTCTCTTCGGCTCTCTCCGTCACTCGCTCTCGCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057800109.1
MENEETINDKSEAEVSDAVVGHHFPCHFDGGGGQEDAKSYGDELAVPEPLGRRKDILKALEAVERDSAAIAESFSSLFGSLRHSLSQATGSTVEHMNCFSDAAGRLQECVLDAATKGNRYINSCLRLNEEMKDMDALATKLYPFICSFCPFPKRSYIGVFAANLYKPLQLVISSPLVTVNGISYVAYDTLKEDHI

XP_057800110.1
MENEETINDKSEAEVSDAVVGHHFPCHFDGGGGQEDAKSYGDELAVPEPLGRRKDILKALEAVERDSAAIAESFSSLFGSLRHSLSQATGSTVEHMNCFSDAAGRLQECVLDAATKGNRYINSCLSFFEITYCRLNEEMKDMDALATKLKFLRRHVDALDSVVNRVVRLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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