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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr03G001805

染色体: Chr03 坐标: 24666988-24675013 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr03G001805
名称SmilChr03G001805
描述kinesin-like protein KIN-14J
染色体 / SeqIDChr03 / NC_080389.1
坐标与链方向24666988 - 24675013 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131015699
GeneID131015699
locus_tag-
NCBI NameLOC131015699
原始查询SmilChr03G001805

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述kinesin-like protein KIN-14J
产物kinesin-like protein KIN-14J
ArabidopsisAT1G63640 (AT1G63640)
P-loop nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein with CH (Calponin Homology) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842668]
identity=55.4; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
RiceOs01g0744000 (KIN14C)
-
identity=63.8; qcov=0.716; evalue=0; confidence=high
GOGO:0003777 (microtubule motor activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0007018 (microtubule-based movement); GO:0008017 (microtubule binding)
KEGG-
PfamPF00225 (Kinesin); PF16796 (Microtub_bd)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131015699

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoskeleton 细胞骨架 1.00000 XP_057800095.1
2 Spindle Spindle 1.00000 XP_057800095.1
3 Spindle pole Spindle pole 0.80000 XP_057800095.1
4 Phragmoplast Phragmoplast 0.60000 XP_057800095.1
5 Midbody Midbody 0.60000 XP_057800095.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr3:24670215 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B12
Chr3:24670984 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C56
Chr3:24672894 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A18
Chr3:24673010 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B125,C73
Chr3:24673414 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B36,B83,C59
Chr3:24673979 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B52,B75,B9
Chr3:24674054 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B2,B71
Chr3:24674076 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11
Chr3:24674527 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B2,B71
Chr3:24674673 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B63,B83
Chr3:24674682 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B47,B57,B78,C33,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800095.1
926 aa
N
1
463
926
Microtub_bd
Kinesin
C
PF16796 Microtub_bd 317-476 aa PF00225 Kinesin 336-656 aa
XP_057800096.1
926 aa
N
1
463
926
Microtub_bd
Kinesin
C
PF16796 Microtub_bd 317-476 aa PF00225 Kinesin 336-656 aa
XP_057800097.1
926 aa
N
1
463
926
Microtub_bd
Kinesin
C
PF16796 Microtub_bd 317-476 aa PF00225 Kinesin 336-656 aa
XP_057800098.1
926 aa
N
1
463
926
Microtub_bd
Kinesin
C
PF16796 Microtub_bd 317-476 aa PF00225 Kinesin 336-656 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057800095.1 Pfam PF16796 Microtub_bd Domain 317 476 6e-45 153.6 Microtubule binding
XP_057800095.1 Pfam PF00225 Kinesin Domain 336 656 6.6e-107 358.0 Kinesin motor domain
XP_057800096.1 Pfam PF16796 Microtub_bd Domain 317 476 6e-45 153.6 Microtubule binding
XP_057800096.1 Pfam PF00225 Kinesin Domain 336 656 6.6e-107 358.0 Kinesin motor domain
XP_057800097.1 Pfam PF16796 Microtub_bd Domain 317 476 6e-45 153.6 Microtubule binding
XP_057800097.1 Pfam PF00225 Kinesin Domain 336 656 6.6e-107 358.0 Kinesin motor domain
XP_057800098.1 Pfam PF16796 Microtub_bd Domain 317 476 6e-45 153.6 Microtubule binding
XP_057800098.1 Pfam PF00225 Kinesin Domain 336 656 6.6e-107 358.0 Kinesin motor domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA
XM_057944115.1
TAAATAAAAATTGGTAGACGAAATAGAAAAAGAAAAGGAAAAACCCGATGAGAATTTCAAAACAGTTGAGAGCTTACGAGCTTTCTATTTTCAATCATCATTCCCACATTATCGATTCGCCTTTACTTCTAAATAAAGGTTAAACCCCCAACATTTGCTTTGCCCTCAGCTGCTTTTCTGTTTTCTTCTCATTTTCCCAAAACCCGGAAAAGATACGCGAATGCGGTTTGAAATTTGTTCTCTAGCCTAAGATGAGCTTC...
XM_057944112.1
TAAATAAAAATTGGTAGACGAAATAGAAAAAGAAAAGGAAAAACCCGATGAGAATTTCAAAACAGTTGAGAGCTTACGAGCTTTCTATTTTCAATCATCATTCCCACATTATCGATTCGCCTTTACTTCTAAATAAAGGTTAAACCCCCAACATTTGCTTTGCCCTCAGCTGCTTTTCTGTTTTCTTCTCATTTTCCCAAAACCCGGAAAAGATACGCGAATGCGGTTTGAAATTTGTTCTCTAGCCTAAGATGAGCTTC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA
LOC131015699
ATGGATCCAAAGTCGGAGATTCATGCAACTGAACAAAGGGAGGGTGCTTTAAGTGAAGTTCGAAATGGCAATATTTCTGGAAGAGTTGAAGTTGTTAATGGTCTTGCTGAAGGGAATGGGCATTATTGGGATCTACCAACTTCTAAGATTTCAGAACTGATGAAATTGGGTAATTTGGAGAAGGCCTCCACACACTCACTTTTCATTATTGTCAAGAGGATTTTGGATGACAGAATCGAGAAAAAGGATGAGGACATTCC...
LOC131015699
ATGGATCCAAAGTCGGAGATTCATGCAACTGAACAAAGGGAGGGTGCTTTAAGTGAAGTTCGAAATGGCAATATTTCTGGAAGAGTTGAAGTTGTTAATGGTCTTGCTGAAGGGAATGGGCATTATTGGGATCTACCAACTTCTAAGATTTCAGAACTGATGAAATTGGGTAATTTGGAGAAGGCCTCCACACACTCACTTTTCATTATTGTCAAGAGGATTTTGGATGACAGAATCGAGAAAAAGGATGAGGACATTCC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA
XP_057800095.1
MDPKSEIHATEQREGALSEVRNGNISGRVEVVNGLAEGNGHYWDLPTSKISELMKLGNLEKASTHSLFIIVKRILDDRIEKKDEDIPQRVASVLKLVLQEIEQRVSKQADNMRKQSSLYKSREDRYNVKIRALETLATGTSEENEVVATQLQQMKIEKAKIEENKKREEQDLIKLRKERDVCESQILSLNEKLTLAKTSYEENLLQLESKAEEAKDKLEKKIVNIEFLLTDSRKKVKELEDFSESKLMHWKRKEQRYRQF...
XP_057800096.1
MDPKSEIHATEQREGALSEVRNGNISGRVEVVNGLAEGNGHYWDLPTSKISELMKLGNLEKASTHSLFIIVKRILDDRIEKKDEDIPQRVASVLKLVLQEIEQRVSKQADNMRKQSSLYKSREDRYNVKIRALETLATGTSEENEVVATQLQQMKIEKAKIEENKKREEQDLIKLRKERDVCESQILSLNEKLTLAKTSYEENLLQLESKAEEAKDKLEKKIVNIEFLLTDSRKKVKELEDFSESKLMHWKRKEQRYRQF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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