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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001816`

染色体: Chr03 坐标: 24836391-24838682 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001816`
名称	SmilChr03G001816
描述	tubulin beta-1 chain-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24836391 - 24838682 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015712`
GeneID	`131015712`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015712`
原始查询	`SmilChr03G001816`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubulin beta-1 chain-like
产物	tubulin beta-1 chain-like
Arabidopsis	`AT5G12250` (TUB6) beta-6 tubulin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831100] identity=93.3; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0282800` (OsTUB1) - identity=94.2; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000226 (microtubule cytoskeleton organization); GO:0000278 (mitotic cell cycle); GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005200 (structural constituent of cytoskeleton); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005874 (microtubule)
KEGG	smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04517 (IgSF CAM signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04814 (Motor proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00091 (Tubulin); PF03953 (Tubulin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015712

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057800115.1`
2	Spindle	Spindle	0.40000	`XP_057800115.1`
3	Spindle pole	Spindle pole	0.40000	`XP_057800115.1`
4	Centrosome	中心体	0.20000	`XP_057800115.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24836673`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B133
`Chr3:24836673`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B133
`Chr3:24836878`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C66
`Chr3:24836878`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C66
`Chr3:24836972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:24837179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr3:24838428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C37,C39
`Chr3:24838455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B41,C20,C37,C39
`Chr3:24838470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,C20,C37,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800115.1

447 aa

224

447

Tubulin

Tubulin_C

PF00091 Tubulin 3-211 aa PF03953 Tubulin_C 261-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800115.1`	Pfam	`PF00091`	Tubulin	Domain	3	211	3.1e-65	220.8	Tubulin/FtsZ family, GTPase domain
`XP_057800115.1`	Pfam	`PF03953`	Tubulin_C	Domain	261	382	3.9e-40	137.6	Tubulin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944132.1
AGCTCAGAAACTCCTGTTGATCCTTGACATGGTGGCCGAAAAAACAAGCCCACATTAAATTATTAAACTCTAACCATCGATATATTCTTATCTCTTCACATTTAAATATGCAAAAGAAATATCAACGTCTCAATCATATCATACATACTATAATTAATCATCTCCCCCTTCACTACAAAAACACCAACACTACTCTCCTCTCCATAGCCTATAGCTACTACAACTTGGGTTGATCCATCAAAGATACAGAAAAACAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015712
ATGAGAGAAATTCTTCACATCCAAGCAGGGCAATGCGGCAACCAAATCGGCGGCAAGTTCTGGGAAGTGGTGTGCGAAGAGCACGGCATCAACGAGGTCGGAAACTACGTGGGGACGTCGAAAAACGAGCTGGAAAGGATCAACGTTTACTACAACGAGGCTAGCGGAGGGCGGTACGTGCCCCGGGCGGTGCTGATGGACCTGGAGCCCGGGACGATGGACAGCCTGAGAACCGGGCCTTACGGGAAGATATTCCGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800115.1
MREILHIQAGQCGNQIGGKFWEVVCEEHGINEVGNYVGTSKNELERINVYYNEASGGRYVPRAVLMDLEPGTMDSLRTGPYGKIFRPDNFVFGQNGAGNNWAKGHYTEGAELIDSVLDVVRKEAENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTNPSFGDLNHLISTTMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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