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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001830`

染色体: Chr03 坐标: 25064286-25069138 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001830`
名称	SmilChr03G001830
描述	multiple C2 domain and transmembrane region protein 7-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	25064286 - 25069138 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019180`
GeneID	`131019180`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019180`
原始查询	`SmilChr03G001830`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	multiple C2 domain and transmembrane region protein 7-like
产物	multiple C2 domain and transmembrane region protein 7-like
Arabidopsis	`AT4G11610` (AT4G11610) C2 calcium/lipid-binding plant phosphoribosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826766] identity=74.2; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0683800` - identity=73.6; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF08372 (PRT_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019180

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057803848.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057803848.1`
3	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057803848.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057803848.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057803848.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:25064828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B14
`Chr3:25064965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr3:25065161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B1,B33,C8,C82
`Chr3:25065203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:25065212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B71
`Chr3:25065302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:25065317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B1,B33,C82
`Chr3:25065336`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B5,B57,C28
`Chr3:25065336`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B5,B57,C28
`Chr3:25065338`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B5,B57,C28
`Chr3:25065338`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B5,B57,C28
`Chr3:25065394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803848.1

1021 aa

510

1021

PRT_C

PF00168 C2 25-116 aa PF00168 C2 287-389 aa PF00168 C2 450-553 aa PF00168 C2 611-721 aa PF08372 PRT_C 866-1021 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803848.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	25	116	2.2e-83	276.0	C2 domain
`XP_057803848.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	287	389	2.2e-83	276.0	C2 domain
`XP_057803848.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	450	553	2.2e-83	276.0	C2 domain
`XP_057803848.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	611	721	2.2e-83	276.0	C2 domain
`XP_057803848.1`	Pfam	`PF08372`	PRT_C	Family	866	1021	2.4e-80	268.6	Plant phosphoribosyltransferase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947865.1
CTCCATTTTCTGCTGGCTCCAAAGAGTAGTCAATAATGACACCATTTTTTTTTTCTCAAGTCTCATTTACACCACACCCATTTTCTTCAAATTTAGGCTCTCCATTAGCCAGGTTCTGAATAAATACCAAAACTTGTTTCAAGATAACGGAAAACAGCTTCGTGGGTCATTCACATTGTGTTGAAAAGATTCAAATTTTCCCATACTTTCACAAGCTCGTTTTCTGCGTGTTCATTTTTCTTGTCACGAGATCTAAACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019180
ATGCATAACTTTGGACTGATCTCTGTAGTTTTTGATAGCTCGGTGGTAAGCACGATGACTGTTGGAAACCTAAAGCTTGGGGTAGATGTTATTAGTGCTCATAACCTTTTGCCTAAAGACGGTCAGGGTTCGTCTAGTGCTTTTGTGGAGCTTTGCTTTGATGGCCAGAGATACCGCTCCACGACCAAAGACAAAGATCTTAGTCCCGTGTGGAACGAGAGCTTTTACTTCAATATATCAGATCCTGCCATCCTCCACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803848.1
MHNFGLISVVFDSSVVSTMTVGNLKLGVDVISAHNLLPKDGQGSSSAFVELCFDGQRYRSTTKDKDLSPVWNESFYFNISDPAILHSLALDAYVYNNVRGIQSRTFLGKVSINGTSFVPYSDAVVLHYPLEKRGIFSRVRGELGLKVYITDDPSIKSSIPASMADESHLSSESGHRSISNAAHHVKIEAARHTFHTLPRRGDSDEQAPVVEEPHHVTKYMGDEMKAPEPMPPKLVHMHSVSSAQPVDFALKETSPFLGGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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