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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001833`

染色体: Chr03 坐标: 25140364-25141017 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001833`
名称	SmilChr03G001833
描述	uncharacterized SmilChr03G001833
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	25140364 - 25141017 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018574`
GeneID	`131018574`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018574`
原始查询	`SmilChr03G001833`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=33.5; qcov=0.756; evalue=2.42e-25; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018574

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803271.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803271.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803271.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803271.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803271.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:25140407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:25140432`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	D10,D6
`Chr3:25140432`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	D10,D6
`Chr3:25140436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A2,C18,C2
`Chr3:25140436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C18,C2
`Chr3:25140469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A7,B78
`Chr3:25140469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B78
`Chr3:25140541`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A6,B12,B126,B139,B55,B59,B66,B67,B75,C13,C25,C32,C53,C64,C66
`Chr3:25140547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	152	A11,A14,A15,A19,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A8,B1,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B111,B113,B114,B115,B12,B122,B123,B124,B126,B127,B133,B134,B137,B139,B140,B16,B17,B18,B2,B20,B21,B25,B28,B29,B3,B31,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B42,B43,B44,B46,B47,B48,B5,B51,B52,B55,B56,B59,B6,B60,B61,B65,B66,B67,B68,B7,B71,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B86,B88,B9,B91,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C11,C13,C17,C18,C2,C21,C22,C23,C25,C28,C29,C32,C33,C34,C37,C38,C39,C4,C42,C43,C44,C48,C49,C50,C51,C53,C54,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C64,C65,C66,C67,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C78,C81,C84,C85,C86,C9,D2,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:25140564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B110,B47
`Chr3:25140568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C32,C61,C68
`Chr3:25140568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C61,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803271.1

217 aa

108

217

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

PF19259 Ty3_capsid 35-199 aa PF03732 PEG10_N-capsid 37-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803271.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	35	199	1.9e-11	44.5	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057803271.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	37	115	7.4e-12	46.2	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947288.1
ATGCCGCAAAGAAGAAGGAATCAAGTTCAGGAAGAAGAAAAGCGTGAAATTATGCCACCACCACCCCCACCCCAAGAAAGGAGAATAGAAGAAATCTTCCTATGCCAAAACCCACCAGTTTTTGATGGAAAAGGTGATCCTGCAGTAACTGAGGAATGGATTCGGTCAATGGAAAGGATTTTTCGATTGTTACGCTGTAACGACCAGGAACGAATCATGTGTATGTCCTATCAGCTTAAGGGCTCAACCGATTTCTGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018574
ATGCCGCAAAGAAGAAGGAATCAAGTTCAGGAAGAAGAAAAGCGTGAAATTATGCCACCACCACCCCCACCCCAAGAAAGGAGAATAGAAGAAATCTTCCTATGCCAAAACCCACCAGTTTTTGATGGAAAAGGTGATCCTGCAGTAACTGAGGAATGGATTCGGTCAATGGAAAGGATTTTTCGATTGTTACGCTGTAACGACCAGGAACGAATCATGTGTATGTCCTATCAGCTTAAGGGCTCAACCGATTTCTGGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803271.1
MPQRRRNQVQEEEKREIMPPPPPPQERRIEEIFLCQNPPVFDGKGDPAVTEEWIRSMERIFRLLRCNDQERIMCMSYQLKGSTDFWWKAKQKTMTPGQLEKLTWEEFKTALCEKYIPRSYRRKKEMEFVNLRQGKKTVAEYDREFYDLARYAPYRVDSDEKMSELFCAALRQEIRIVLASQHALTYAEALNRALDMELAMQPERPTAGSQPSETPNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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