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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr03G001842

染色体: Chr03 坐标: 25315741-25323625 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr03G001842
名称SmilChr03G001842
描述probable GPI-anchored adhesin-like protein PGA55
染色体 / SeqIDChr03 / NC_080389.1
坐标与链方向25315741 - 25323625 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131013916
GeneID131013916
locus_tag-
NCBI NameLOC131013916
原始查询SmilChr03G001842

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述probable GPI-anchored adhesin-like protein PGA55
产物probable GPI-anchored adhesin-like protein PGA55
Arabidopsis-
-
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131013916

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057797822.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.40000 XP_057797823.1
3 Cytosol 细胞质基质 0.40000 XP_057797823.1
4 Nucleoplasm 核质 0.20000 XP_057797822.1
5 Nucleus membrane 核膜 0.20000 XP_057797823.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA
XM_057941839.1
TTTCCCTGCCTCTTTTCTTATTTTTCCTTTGGGGGGTGGGGGTTGGGGGTTGGGGTTCTTTTTCTGCTCTGATGTTTCTATTGCCAACTTCTCTCCAGTGAACCAGAAATTGATATCTTTGAATCAATTGACAAACAGAGGCGCGCAGATGAAATGGTTGTGTGGCAAAATTTGTGTGGTGTAAAAGGGTCAGATAAAAGCAAGCTTATACCTCCATTGCCTTCTCGGCTTATAACAGAGGATGACTTAAAATCATTTTA...
XM_057941841.1
AAGTGAACCTCAACAGAAAAGAACTCGGGCTTCTGTTGGACGGAAAGACAGCGTAAGACGTGAGAAGGTTCAGGAATTATCAAATGCAAGTCAATATGCTGGACAAGGTATTCAAGATTCTTTGGCAGAAGGAGTTCCTAAGGATGTTTTTGCAGACGCTACTGTAGATACAGAGATTGGTGCAGACAATTTACAATACCCTCAAGAACAAGATGCAAATGAAAAGCCAAGCAGGGATCATGGGAATGAAGTCCTTGCTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA
LOC131013916
ATGCATGTAGAACCTGGTCCTGATGCTGTGGTCTGCGCTACTCATGTCGGGAGTAACACTGGGAGCTCAAAAGAGTTGAAGTTGCCTGCTACTCCAAACCCTGGACCATCTGTTCCCCCTTCTCCCATTCCTGCTTCACCCCCATCATCTGGGCGAGGTAGAGGACGAGGTCGGAAGTCCCAGACAGGTGGAGAAGCTCCTGCTCCCAGACGCCGAGGCAAAAGACAGACTGCAGCATTACAAACAGTTCAAATAACTTC...
LOC131013916
ATGAAAAGCACAGAAGATGAATCTGGAATAGCTGTAGTGAATGAACATGAAACCAGTACTGCTGATGAAGTACCTGTTTCTACCACTGACTTTCATGTGGATCATTCTGATATCACCACTATAGAAGAAGGCTGCACCGAACCAGATTCAGCTTCAGAACAAGGAGTCATAATGAGCACATTAACAGCTTCTGCTCACGCTTCAATAAATCCAATGGCTGTAGCAAGTTCTGATCAACTAGCTCCTAACATTTTGTCCAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA
XP_057797822.1
MHVEPGPDAVVCATHVGSNTGSSKELKLPATPNPGPSVPPSPIPASPPSSGRGRGRGRKSQTGGEAPAPRRRGKRQTAALQTVQITSSPLVTDNPAVEIQGEVALTAAMTTSSTSVSVTSSTKEVGTEPDSVSPSPVVPSASIPSNSDVEPQPGVTPNSVPSNPVAVASVNQADPGIVLTSNPVATPPPLPIGPSLPITTQGRGRGRGRGRGRGQNAQSREEAPQRRRRRQDPVVSTVSGALTSQASELSEPQQKRTRAS...
XP_057797823.1
MKSTEDESGIAVVNEHETSTADEVPVSTTDFHVDHSDITTIEEGCTEPDSASEQGVIMSTLTASAHASINPMAVASSDQLAPNILSMSSVQTTEEDISDSSAGQVPKGCAKDVVKLGDPLQEKDTVEKEGECEEPDIRTQHDDEDHCGASPSISTLLSQSDGNNHGTAEGSQCLLEMHNNSTELEKERTTVQAAAILASTSLTAVSDQFDSPSGKEDGKIIFSDETPNMDEFLVSKNISAKATHDASFEYVPQSSDGENI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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