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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr03G001843

染色体: Chr03 坐标: 25324563-25326799 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr03G001843
名称SmilChr03G001843
描述probable serine/threonine-protein kinase PBL26
染色体 / SeqIDChr03 / NC_080389.1
坐标与链方向25324563 - 25326799 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131013917
GeneID131013917
locus_tag-
NCBI NameLOC131013917
原始查询SmilChr03G001843

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述probable serine/threonine-protein kinase PBL26
产物probable serine/threonine-protein kinase PBL26
ArabidopsisAT3G07070 (AT3G07070)
Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819893]
identity=70.4; qcov=1.02; evalue=5.99e-142; confidence=high
RiceOs04g0393900 (OsRLCK149)
-
identity=61.3; qcov=1.1; evalue=2.06e-124; confidence=high
GOGO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG-
PfamPF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131013917

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cell membrane 细胞膜 1.00000 XP_057797825.1
2 Cytosol 细胞质基质 0.80000 XP_057797825.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057797825.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057797825.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057797825.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797825.1
278 aa
N
1
139
278
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
C
PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 1-226 aa PF00069 Pkinase 2-220 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057797825.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 1 226 8.4e-36 124.3 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057797825.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 2 220 1.3e-35 123.8 Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057941842.1
AAGTGAAGTGATTGCTTTGACTTCAGCTGGTAGCAGTTAAGCAGCTTGATCGCAACGGATTGCAAGGGAACCGAGAGTTTCTTGTAGAGGTTTTGATGTTGAGCCTTCTACACCACCAGAATCTCGTAAACCTAATCGGCTATTGCGCCGACGGCGAGCAGAGACTTCTCGTCTATGAATATATGCAGTTGGGATCTCTTGAAGACCATCTACTTGATTTGCCGCGTAATCGGTCTCCACTGCCTTGGTTCACGAGGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131013917
ATGTTGAGCCTTCTACACCACCAGAATCTCGTAAACCTAATCGGCTATTGCGCCGACGGCGAGCAGAGACTTCTCGTCTATGAATATATGCAGTTGGGATCTCTTGAAGACCATCTACTTGATTTGCCGCGTAATCGGTCTCCACTGCCTTGGTTCACGAGGATGAAGATCGCGTTGCATGCGGCCAAAGGTCTTGAGTATTTGCACGATAAGGCGAACCCTCCGGTGATCTATCGTGACTTGAAATCGTCAAACATCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057797825.1
MLSLLHHQNLVNLIGYCADGEQRLLVYEYMQLGSLEDHLLDLPRNRSPLPWFTRMKIALHAAKGLEYLHDKANPPVIYRDLKSSNILLDKDYNAKLSDFGLAKLGPIGEKSHVSTRVMGTYGYCAPEYQRTGQLTVKSDVYSFGVVLLELITGKRAIDNRRIPDHQNLVTWAEPIFMEPSRFSELADPLLRGDFPKKSFNQAVAISAMCLQEDATVRPLISDVVTALSCLPLQGDTGYSRPVSPPSPRLNAEITPQDRER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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