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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001850`

染色体: Chr03 坐标: 25427666-25432769 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001850`
名称	SmilChr03G001850
描述	IRK-interacting protein-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	25427666 - 25432769 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013922`
GeneID	`131013922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013922`
原始查询	`SmilChr03G001850`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	IRK-interacting protein-like
产物	IRK-interacting protein-like
Arabidopsis	`AT5G12900` (AT5G12900) DNA double-strand break repair RAD50 ATPase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831130] identity=61.3; qcov=0.926; evalue=5.21e-171; confidence=high
Rice	`Os08g0508100` - identity=54; qcov=0.939; evalue=1.59e-150; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24994 (GIL1_IRKI_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797829.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057797830.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057797830.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057797829.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057797830.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:25427982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:25428169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr3:25428404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr3:25428499`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B73,B82,B98,C12,C15,C40,C55,C59,C8
`Chr3:25428521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C33
`Chr3:25429217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A24,B46,B50,D3
`Chr3:25429276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B129,B132,B2,C12
`Chr3:25429538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797829.1

540 aa

270

540

GIL1_IRKI_C

PF24994 GIL1_IRKI_C 483-533 aa

XP_057797830.1

444 aa

222

444

GIL1_IRKI_C

PF24994 GIL1_IRKI_C 387-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797829.1`	Pfam	`PF24994`	GIL1_IRKI_C	Domain	483	533	2.2e-06	28.3	GIL1/IRKI C-terminal domain
`XP_057797830.1`	Pfam	`PF24994`	GIL1_IRKI_C	Domain	387	437	1.1e-06	29.2	GIL1/IRKI C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941846.1
AAAACTACACAACAAACTCTCTCTCTCTCTCTAGGTTCACATGCAGTCCTTTCATCACACTCTACTACGAGCAAAGACAAGAGACTTCCCTCTTTCTAGTCTCTACCCATTAAAAAAAATCGAATAATTAAGTGGCCCTCAAAAAAAAAAATCAAAAAAGTCCCTCTGTCGCTCTCTCTCTCAAGGTTCACATGCACTCCTTCCATTACACTTCACTATGAGCAAAGACAAATCATCATTCCATTTAACCTCTCTCTCTC...

XM_057941847.1
CGGCAGGCGAGATATTGAAGCCGCCATGGCAAAAGCCGTGGAGCTCAGGGCTCTTCATGCTTCAATGTTGCACTCTGCTTCCCCTCTCTCCCGCCATGCCACCTACTTTTCTGCCCAAGATTATCCAGTTTTTACCCCAGGTATCGGCAAGCTCTGCCGGAAAATCCTCAAAACTGGAAGGATTACAATTTGGATGCCAGAAACCACAGTCAAACCATGCCATCAGATTACAGAAGTGCAAATGCTTCTTCAAGGAAAGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013922
ATGGCGGCAATCGACCACCACGAAGCCAACGGTGAAAATGGGATTGTCGGCAGGCGAGATATTGAAGCCGCCATGGCAAAAGCCGTGGAGCTCAGGGCTCTTCATGCTTCAATGTTGCACTCTGCTTCCCCTCTCTCCCGCCATGCCACCTACTTTTCTGCCCAAGATTATCCAGTTTTTACCCCAAGTTACGAGGAGGAACCATTGACAGGGTATCGGCAAGCTCTGCCGGAAAATCCTCAAAACTGGAAGGATTACAA...

LOC131013922
ATGCCATCAGATTACAGAAGTGCAAATGCTTCTTCAAGGAAAGGGTATAGAGATGGAGCAGACGACGAAAACTCCGTGGTAGGTTCTTGTTCCAACAACATTGGTGGTGTACCAGATTACTCCAAATCGAGGAGGACTAGTTTAGGAGACATGGAATCGGTGTCATCTTGCAAGCCGGCAGCTGCCGACGATGCGATGAAGAGCAGCAGGAAGTCCAACATGGTGGTGCCATTGACGGACTCGCACTCCTCGCTCCACTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797829.1
MAAIDHHEANGENGIVGRRDIEAAMAKAVELRALHASMLHSASPLSRHATYFSAQDYPVFTPSYEEEPLTGYRQALPENPQNWKDYNLDARNHSQTMPSDYRSANASSRKGYRDGADDENSVVGSCSNNIGGVPDYSKSRRTSLGDMESVSSCKPAAADDAMKSSRKSNMVVPLTDSHSSLHSNPRHKGLSLSWLFPKLKKKGNSSPAEEVSQMLSDLGVLTMDALRKELTEAHQSRDAALLEAAEMKKSLRELAQKLHY...

XP_057797830.1
MPSDYRSANASSRKGYRDGADDENSVVGSCSNNIGGVPDYSKSRRTSLGDMESVSSCKPAAADDAMKSSRKSNMVVPLTDSHSSLHSNPRHKGLSLSWLFPKLKKKGNSSPAEEVSQMLSDLGVLTMDALRKELTEAHQSRDAALLEAAEMKKSLRELAQKLHYLEAYCEDMKKALRQAVQVKASLAAEKSVSLPKRGNANTESSMPVSEEAMVEGFLQMVSEARLSVKQFCKTLVAQIEETDHTLLDNLNSLLQPHNLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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