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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001856`

染色体: Chr03 坐标: 25588944-25589594 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001856`
名称	SmilChr03G001856
描述	uncharacterized SmilChr03G001856
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	25588944 - 25589594 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018583`
GeneID	`131018583`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018583`
原始查询	`SmilChr03G001856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=low
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=40.3; qcov=0.333; evalue=6.82e-09; confidence=low
Rice	`Os12g0292200` - identity=40.4; qcov=0.264; evalue=5.4e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018583

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803280.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803280.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803280.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803280.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803280.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:25588957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B137,B16,C19
`Chr3:25588981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B137,B16,C19
`Chr3:25588983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B137,B16,C19
`Chr3:25588985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,C60,D7
`Chr3:25588996`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	B1,B115,B120,B122,B127,B138,B28,B30,B37,C3,C32,C38,C68,C85,D4,D7
`Chr3:25589000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B87,C65,D1
`Chr3:25589021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:25589028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr3:25589033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:25589046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	B103,B110,B125,B13,B30,B36,B40,B65,B92,C17,C30,C35,C5,C50,C68,C7,C75,C76,D4
`Chr3:25589055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B73,B74,C50,C78
`Chr3:25589060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803280.1

216 aa

108

216

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 51-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803280.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	51	142	2e-06	29.1	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947297.1
ATGCCACAATATGCCAAATTCCTCAAGGACATAGTCTCGCGCAAGAAAAAGATGGGGGAGTTTGAGAGTGTGAAGCTCAATGAAGAATGCAACGCGATTTTGCAGAGGAAGCTGCCGGCGAAGATCAAGGATCTGGGCAGTTTCAATATTTCTTGCATTATTGGAGGCCAGCATTTCGAGAAGGCACTGTGCGATTTGGGGGCGAATATCAATCTCATGCCTTTATCTGTTTTTCAGCAGCTGACAATTGGGGAGTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018583
ATGCCACAATATGCCAAATTCCTCAAGGACATAGTCTCGCGCAAGAAAAAGATGGGGGAGTTTGAGAGTGTGAAGCTCAATGAAGAATGCAACGCGATTTTGCAGAGGAAGCTGCCGGCGAAGATCAAGGATCTGGGCAGTTTCAATATTTCTTGCATTATTGGAGGCCAGCATTTCGAGAAGGCACTGTGCGATTTGGGGGCGAATATCAATCTCATGCCTTTATCTGTTTTTCAGCAGCTGACAATTGGGGAGTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803280.1
MPQYAKFLKDIVSRKKKMGEFESVKLNEECNAILQRKLPAKIKDLGSFNISCIIGGQHFEKALCDLGANINLMPLSVFQQLTIGELKPTSMRLQMADRSVTYPCGIVEDVLVKVGDFIFPADFVVLDIEDDNKIPLILGRSFLATGRALIDVEKEELTLRVHDESQKFSVYEPCRIYKDEVPKKAKVTGNVRVDVQNIFNEDHLSWQDPGDQNSKG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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