当前解析结果
SmilChr03G001862| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001862 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001862 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001862 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 25711783 - 25712259 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018585 |
|---|---|
| GeneID | 131018585 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018585 |
| 原始查询 | SmilChr03G001862 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018585 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803282.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057803282.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803282.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803282.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803282.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:25711795 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B125,C86 |
Chr3:25711796 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B35,C32,C56,C68,D8 |
Chr3:25711797 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B125 |
Chr3:25711801 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C80 |
Chr3:25711837 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,C56,C72 |
Chr3:25711845 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C16,C32,C68 |
Chr3:25711879 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 12 | A15,B20,B56,B62,B96,C44,C62,C64,C66,C80,C81,C86 |
Chr3:25711882 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A24 |
Chr3:25711884 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C44,C57,C67 |
Chr3:25711887 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B115,C56,C6,C67,D9 |
Chr3:25711891 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,B137,B16,C19 |
Chr3:25711899 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B115,C56,C6,D7,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。