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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001876`

染色体: Chr03 坐标: 26022430-26045369 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001876`
名称	SmilChr03G001876
描述	callose synthase 3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	26022430 - 26045369 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013941`
GeneID	`131013941`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013941`
原始查询	`SmilChr03G001876`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	callose synthase 3-like
产物	callose synthase 3-like
Arabidopsis	`AT5G13000` (GSL12) glucan synthase-like 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831140] identity=84.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0182300` (GSL5) - identity=61.4; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000148 (1,3-beta-D-glucan synthase complex); GO:0003843 (1,3-beta-D-glucan synthase activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006075 ((1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF02364 (Glucan_synthase); PF04652 (Vta1); PF14288 (FKS1_dom1); PF25968 (CALS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013941

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797858.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797858.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797858.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797858.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797858.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:26025001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,C51,C64,C66,D4
`Chr3:26027785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr3:26030617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:26032918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B118,B77,C53,C58
`Chr3:26033598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B71
`Chr3:26033773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B98
`Chr3:26033773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr3:26033954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B64,B84,C80,C84
`Chr3:26033954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B84,C80,C84
`Chr3:26035796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B34,B61,B86,C36
`Chr3:26041567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr3:26041619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797858.1

1946 aa

973

1946

Vta1

FKS1_dom1

CALS1

Glucan_synthase

PF04652 Vta1 44-169 aa PF14288 FKS1_dom1 321-433 aa PF25968 CALS1 855-1042 aa PF02364 Glucan_synthase 1049-1758 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797858.1`	Pfam	`PF04652`	Vta1	Family	44	169	4.5e-17	63.1	Vta1 like
`XP_057797858.1`	Pfam	`PF14288`	FKS1_dom1	Family	321	433	4.8e-42	143.5	1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1
`XP_057797858.1`	Pfam	`PF25968`	CALS1	Domain	855	1042	6.5e-64	215.7	Callose synthase 1 domain
`XP_057797858.1`	Pfam	`PF02364`	Glucan_synthase	Family	1049	1758	5.1e-238	793.1	1,3-beta-glucan synthase component

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941875.1
ACCCACGCACTTCCCTCACAATAATCCAAAATTTTCAATTTACCTCTCATCCCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTTACTTTGTTGCTGCTGAAAGCCACTGTCTCACCCACACTGCCTTTATCACCCTCATCCCATTCTCTCTCTCTCTTTAGGGTTGCTGCATTTCCTTCTCCAGCAGCACAGTACCGCTCTCCAACTCAATAGCCACAGCTGCAAGTAATGCACGCAGACAGGAATATCCAGCTACCATATTTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013941
ATGGCATCAAGAGGTGGGCCCTCACAGCAGAACCCACAGCTGCAGCGGCGGATTACACGCACGCAGACGGTTGGGAATCTTGGAGAGTCTATTTTTGACAGTGAAGTAGTTCCTTCGTCTTTAGTGGAAATTGCCCCCATTCTACGTGTTGCCAATGAAGTCGAGCCCAGCAATCCTCGTGTTGCATATCTATGTAGGTTTTATGCTTTTGAGAAAGCTCATAGGTTGGATCCCACATCAAGTGGACGTGGTGTCCGTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797858.1
MASRGGPSQQNPQLQRRITRTQTVGNLGESIFDSEVVPSSLVEIAPILRVANEVEPSNPRVAYLCRFYAFEKAHRLDPTSSGRGVRQFKTALLQRLERENDPTLMGRVKKSDAREMQSFYQHYYKKYIQALQNAADKADRAQLTKAYQTANVLFEVLKAVNQTQSVEVDREILETHDKVAEKTEIYVPYNILPLDPDSANQAIMKYPEIQAAVLALRNTRGLPWPKDYKKKKDEDILDWLQAMFGFQKDSVANQREHLIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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