当前解析结果
SmilChr03G001878| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001878 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001878 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001878 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 26068383 - 26069999 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018589 |
|---|---|
| GeneID | 131018589 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018589 |
| 原始查询 | SmilChr03G001878 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018589 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803285.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803285.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057803285.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057803285.1 |
| 5 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057803285.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:26068404 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C79 |
Chr3:26068404 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C79 |
Chr3:26068416 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B119,B87 |
Chr3:26068424 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B114,B22 |
Chr3:26068427 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C57 |
Chr3:26068429 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C5 |
Chr3:26068430 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B128,B56,C67,C74 |
Chr3:26068442 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B58,C68 |
Chr3:26068447 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B106,C33,D9 |
Chr3:26068447 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B106,C33,D9 |
Chr3:26068449 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B53,B66,D2 |
Chr3:26068455 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 47 | A6,A7,B102,B105,B112,B113,B119,B12,B120,B131,B132,B135,B14,B15,B17,B26,B44,B45,B48,B50,B52,B55,B57,B7,B74,B75,B78,B82,B93,B94,C10,C11,C13,C21,C25,C29,C40,C56,C57,C68,C74,C77,C78,C85,C87,D4,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。