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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr03G001886

染色体: Chr03 坐标: 26266367-26267052 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr03G001886
名称SmilChr03G001886
描述ABC transporter C family member 8-like
染色体 / SeqIDChr03 / NC_080389.1
坐标与链方向26266367 - 26267052 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131018592
GeneID131018592
locus_tag-
NCBI NameLOC131018592
原始查询SmilChr03G001886

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述ABC transporter C family member 8-like
产物ABC transporter C family member 8-like
ArabidopsisAT3G21250 (ABCC8)
multidrug resistance-associated protein 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821679]
identity=82; qcov=1; evalue=5.9e-63; confidence=high
RiceOs05g0196100 (OsABCC14)
-
identity=73.5; qcov=1; evalue=9.78e-59; confidence=high
GOGO:0000325 (plant-type vacuole); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005774 (vacuolar membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0042626 (ATPase-coupled transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG-
PfamPF00005 (ABC_tran)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131018592

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057803288.1
2 Cytosol 细胞质基质 0.20000 XP_057803288.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057803288.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057803288.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057803288.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803288.1
117 aa
N
1
58
117
ABC_tran
C
PF00005 ABC_tran 2-94 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057803288.1 Pfam PF00005 ABC_tran Domain 2 94 4.5e-16 60.4 ABC transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057947305.1
TTCGAGGAAGGGAAGAGAGTGGGAGTCGTGGGCAGGACGGGAAGTGGGAAAACGACGTTGATCAGTGCTTTGTTTCATCTGGTTGAGCCTCACAGCGGGCGTATCCTGGTAGATGGACTTGATATATGCTGCATTGGGCTTAGAGATTTGAGGCTGAAACTCAGCATTATTCCTCAAGAGCCAACGCTGTTTAGGGGAAGTGTTAGAACAAATCTTGATCCATTAGGCCTTTACTCTGATGATGAGATATGGAAGGCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131018592
TTCGAGGAAGGGAAGAGAGTGGGAGTCGTGGGCAGGACGGGAAGTGGGAAAACGACGTTGATCAGTGCTTTGTTTCATCTGGTTGAGCCTCACAGCGGGCGTATCCTGGTAGATGGACTTGATATATGCTGCATTGGGCTTAGAGATTTGAGGCTGAAACTCAGCATTATTCCTCAAGAGCCAACGCTGTTTAGGGGAAGTGTTAGAACAAATCTTGATCCATTAGGCCTTTACTCTGATGATGAGATATGGAAGGCACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057803288.1
FEEGKRVGVVGRTGSGKTTLISALFHLVEPHSGRILVDGLDICCIGLRDLRLKLSIIPQEPTLFRGSVRTNLDPLGLYSDDEIWKALEKCQLKSTISGMPNLLESSVSDEGENWSMG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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