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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001897`

染色体: Chr03 坐标: 26513453-26515653 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001897`
名称	SmilChr03G001897
描述	uncharacterized SmilChr03G001897
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	26513453 - 26515653 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018599`
GeneID	`131018599`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018599`
原始查询	`SmilChr03G001897`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G46460` (AT2G46460) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819255] identity=35.2; qcov=0.34; evalue=4.31e-07; confidence=low
Rice	`Os02g0630250` - identity=34.8; qcov=0.343; evalue=1.31e-08; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018599

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803293.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803293.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803293.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803293.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803293.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:26513481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C3,C35
`Chr3:26513497`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A10,A24,B105,B136,B17,B27,B50,B52,B6,B73,C33,C54,D5
`Chr3:26513524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B63,B72,C28,C35,C41
`Chr3:26513525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,C32
`Chr3:26513526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C62
`Chr3:26513530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B6,C33
`Chr3:26513535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B120,B30,C32,D3
`Chr3:26513535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B30,C32,D3
`Chr3:26513545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B26,B62,B68
`Chr3:26513569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr3:26513587`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A13,B58,B66,B76,B92,B94,C30,C48,C51,C53,C56,C71
`Chr3:26513589`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A13,A21,B58,B66,B76,B92,B94,C30,C48,C51,C56,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803293.1

268 aa

134

268

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 3-76 aa PF13456 RVT_3 181-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803293.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	3	76	4.9e-11	43.8	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057803293.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	181	258	5e-10	40.1	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947310.1
ATGCGTCCTAGCTTTCCGACTGTCGATTGGGGTAAATGGATCTGGGCGCCTTTTATGCCTGTTCGCAGATCTATTGTTACTTGGAGGGTTATTCTGGATCATTTCCAGACGGCCAGTTCACTGCGTCGCCAGGGTTTTATGGGCCATGGTTGGTTCCCGCTTTCTAGAGAAGCTGGGGAGGATATTGATCACCTCTTTTGGGAGTGTGCGATTGCTCGACACGTTTGGAGCTCCCTTTTTTCTTGGTTTCACTTTGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018599
ATGCGTCCTAGCTTTCCGACTGTCGATTGGGGTAAATGGATCTGGGCGCCTTTTATGCCTGTTCGCAGATCTATTGTTACTTGGAGGGTTATTCTGGATCATTTCCAGACGGCCAGTTCACTGCGTCGCCAGGGTTTTATGGGCCATGGTTGGTTCCCGCTTTCTAGAGAAGCTGGGGAGGATATTGATCACCTCTTTTGGGAGTGTGCGATTGCTCGACACGTTTGGAGCTCCCTTTTTTCTTGGTTTCACTTTGATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803293.1
MRPSFPTVDWGKWIWAPFMPVRRSIVTWRVILDHFQTASSLRRQGFMGHGWFPLSREAGEDIDHLFWECAIARHVWSSLFSWFHFDGSSILDIGSLVIWAMKVPASKQVVFVEAPIFDVALTIQVKAFILEAARFNLGEMANSVEELLVLHGLGVPGKPRRPTSYIYVFWLPPPHLWWKINIDGSVHGSPPFIHAGGIIRDSSSVIGCFHFSAGRGWAFEAELFALIIALEHIVVHGWDYIWTETDCTYMVDLFRSRSDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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