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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001904`

染色体: Chr03 坐标: 26595830-26600132 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001904`
名称	SmilChr03G001904
描述	uncharacterized SmilChr03G001904
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	26595830 - 26600132 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018600`
GeneID	`131018600`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018600`
原始查询	`SmilChr03G001904`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=26.5; qcov=0.424; evalue=4.52e-31; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=27.5; qcov=0.563; evalue=1.77e-53; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018600

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803295.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803295.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803295.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803295.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803295.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:26596486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:26596509`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B71
`Chr3:26596509`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B71
`Chr3:26596521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:26596535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:26596544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B9,C26
`Chr3:26596564`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B2
`Chr3:26596564`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B2
`Chr3:26596573`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	79	A10,A15,A21,A22,A3,A4,A5,A6,A9,B1,B10,B100,B102,B111,B117,B118,B120,B124,B125,B127,B132,B134,B137,B139,B14,B18,B19,B23,B27,B28,B34,B36,B42,B43,B45,B46,B5,B55,B56,B59,B61,B70,B73,B77,B79,B82,B84,B87,B9,B96,B98,C18,C2,C23,C25,C28,C33,C34,C36,C40,C42,C45,C46,C5,C53,C55,C56,C58,C62,C65,C7,C72,C75,C77,C78,C80,C85,D5,D8
`Chr3:26596581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr3:26596596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:26596635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,C24,C56,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803295.1

1112 aa

556

1112

RVT_1

RVT_3

PF00078 RVT_1 227-456 aa PF13456 RVT_3 886-1003 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803295.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	227	456	1.3e-20	74.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057803295.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	886	1003	6.2e-17	62.4	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947312.1
ATGGATTGTCTCTGCTCGATGGTTCGGGTTATGAAAAAGCTGAAGCGTCTCCGTCCGACTCTCAAGTCTTGGAATAAAGACACGTTTGGGAATTACAATGTTACCCTCGCCGAGATCCAGCAGGATCTGAGCTCCCTTCAGGAGAATATTGACGAAAGAGGGTATACTGATGATCTCTTTGATCAAGAGGTCAACTTGCAAGCTCGCATTGGCTCGGTCCTCCTGCGTAAGTCGGAGTACCTGCGGCAGCAAAGTAGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018600
ATGGATTGTCTCTGCTCGATGGTTCGGGTTATGAAAAAGCTGAAGCGTCTCCGTCCGACTCTCAAGTCTTGGAATAAAGACACGTTTGGGAATTACAATGTTACCCTCGCCGAGATCCAGCAGGATCTGAGCTCCCTTCAGGAGAATATTGACGAAAGAGGGTATACTGATGATCTCTTTGATCAAGAGGTCAACTTGCAAGCTCGCATTGGCTCGGTCCTCCTGCGTAAGTCGGAGTACCTGCGGCAGCAAAGTAGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803295.1
MDCLCSMVRVMKKLKRLRPTLKSWNKDTFGNYNVTLAEIQQDLSSLQENIDERGYTDDLFDQEVNLQARIGSVLLRKSEYLRQQSRVSWLSDGDRNTRFFHSMVKWRRSNQNVKQLKIDGVISEDPDVMATHVIHFYEDLFSEPIFEPVDRSWISGYIPASVTSAQAAMLTTPPSAEDIRLAVFPWIGIVPLALTGLMALSFSIRGRWWGRTLLLLFAGSSLIAISPWLNEVAAAIVSANQFGFISGRSIQECILLASEG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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