Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001910`

染色体: Chr03 坐标: 26735564-26736589 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001910`
名称	SmilChr03G001910
描述	uncharacterized SmilChr03G001910
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	26735564 - 26736589 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018603`
GeneID	`131018603`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018603`
原始查询	`SmilChr03G001910`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018603

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803298.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803298.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803298.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803298.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803298.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:26735613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:26735641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B34,B56,B60,C73
`Chr3:26735685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A3,B101,B108,B111,B12,B17,B20,B53,B6,B64,B78,B80,C1,C17,C32,C42,C46,C61,C72,C77,C81,C87,D5
`Chr3:26735708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A14,A20,A3,A7,B103,B105,B115,B121,B135,B136,B36,B42,B47,B48,B6,B62,B67,B7,B74,B75,B79,B8,B82,B86,B98,C18,C20,C23,C35,C39,C4,C42,C52,C59,C61,C62,C66,C76,C78,D10
`Chr3:26735719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B105,B64,C24
`Chr3:26735750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	B100,B112,B120,B125,B14,B16,B18,B3,B34,B41,B55,B59,B63,B70,B83,B91,B92,B97,C12,C13,C14,C18,C2,C23,C28,C37,C45,C48,C54,C59,C63,C79,C81
`Chr3:26735783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:26735784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr3:26735791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B35
`Chr3:26735792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B25,B61,C58
`Chr3:26735798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B2,C53,C80,C85
`Chr3:26735804`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B109,B120,B123,B133,B139,B27,B34,B70,B76,B87,C33,C38,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947315.1
ATGGCAGAAAATCCGGAAGGGCAGAATGACAACGCCAACAAGACTCTCCGAGACATGATGTTTCCGAACAACTTGAACCTCCGGCCATCAACCATAGTACTGTCGGAGATCACTGGAAATTGGGAGCTGAAGCATACTCTTATCCAGATTTTGCCCAAGTACAGTGATATGCCCGGAGAGGACCCTCAAAGACATCTCCAAGACTTTGAGATGGCATGTGGAACGGTGCGCACCGCTAGTCAAGCCCTTGGCGAATACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018603
ATGGCAGAAAATCCGGAAGGGCAGAATGACAACGCCAACAAGACTCTCCGAGACATGATGTTTCCGAACAACTTGAACCTCCGGCCATCAACCATAGTACTGTCGGAGATCACTGGAAATTGGGAGCTGAAGCATACTCTTATCCAGATTTTGCCCAAGTACAGTGATATGCCCGGAGAGGACCCTCAAAGACATCTCCAAGACTTTGAGATGGCATGTGGAACGGTGCGCACCGCTAGTCAAGCCCTTGGCGAATACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803298.1
MAENPEGQNDNANKTLRDMMFPNNLNLRPSTIVLSEITGNWELKHTLIQILPKYSDMPGEDPQRHLQDFEMACGTVRTASQALGEYIRLLTFPFSLLEGAREWLYDLPEGSIRTWQELQSKFLEKYFPAARIQNLRTRISNIKMGSGEVLYEYWGRFKQMLAKCPQHQIPDHDLIRYFVGGLPMQDRQWLHAAYGGSILNKSAAEAFKLIADMEEKSRDEEGTIVRTTPVPAPSAQDEKLDKLCNMFEKFMTNQGTPNQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器