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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001928`

染色体: Chr03 坐标: 27064467-27066676 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001928`
名称	SmilChr03G001928
描述	probable plastid-lipid-associated protein 12, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	27064467 - 27066676 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013980`
GeneID	`131013980`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013980`
原始查询	`SmilChr03G001928`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable plastid-lipid-associated protein 12, chloroplastic
产物	probable plastid-lipid-associated protein 12%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G51110` (AT1G51110) Plastid-lipid associated protein PAP / fibrillin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841534] identity=65.7; qcov=0.993; evalue=1.03e-133; confidence=high
Rice	`Os07g0470700` - identity=57.3; qcov=0.996; evalue=1.89e-106; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04755 (PAP_fibrillin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013980

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057797904.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057797904.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057797904.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057797905.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797904.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:27065393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:27065578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B94,C45,D10
`Chr3:27065802`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C64
`Chr3:27065802`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C64
`Chr3:27066143`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B9
`Chr3:27066143`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B9
`Chr3:27066176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B86
`Chr3:27066491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A24,B28,B50,D3
`Chr3:27066500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B139,B87,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797904.1

316 aa

158

316

PAP_fibrillin

PF04755 PAP_fibrillin 3-157 aa

XP_057797905.1

282 aa

141

282

PAP_fibrillin

PF04755 PAP_fibrillin 1-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797904.1`	Pfam	`PF04755`	PAP_fibrillin	Family	3	157	1.4e-43	149.9	PAP_fibrillin
`XP_057797905.1`	Pfam	`PF04755`	PAP_fibrillin	Family	1	123	1.3e-30	107.6	PAP_fibrillin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941921.1
GAGAAAAATCCATTTGATATGTTAATATATGTATGATGAGGCAGGAAGTTGAAAGGGCAGTAGAGAAATTGGAAGATGTAAAGGGCGTTCCAGAACCAACAGGTTCAACCTTAATTGAAGGCCGTTGGCAGTTAATGTTCACAACACGGCCACCAACAGCTTCTCCCATTCAGAGAAGCTTTGTGGGGGTTGATTCGTTCAGTGTATTTCAGGAGATATATCTTCAAACCGACGATCCACGTGTCTCCAATATTATAAAT...

XM_057941922.1
TTCCAGAACCAGTGAGTGAACAGGTTCAACCTTAATTGAAGGCCGTTGGCAGTTAATGTTCACAACACGGCCACCAACAGCTTCTCCCATTCAGAGAAGCTTTGTGGGGGTTGATTCGTTCAGTGTATTTCAGGAGATATATCTTCAAACCGACGATCCACGTGTCTCCAATATTATAAATTTTTCTGATACAATTGGCGACTTGAAAGTAGAGGCATCAGCTTCAGCCAAAGATGGGAAACGGATCCTCTTCCAGTTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013980
ATGATGAGGCAGGAAGTTGAAAGGGCAGTAGAGAAATTGGAAGATGTAAAGGGCGTTCCAGAACCAACAGGTTCAACCTTAATTGAAGGCCGTTGGCAGTTAATGTTCACAACACGGCCACCAACAGCTTCTCCCATTCAGAGAAGCTTTGTGGGGGTTGATTCGTTCAGTGTATTTCAGGAGATATATCTTCAAACCGACGATCCACGTGTCTCCAATATTATAAATTTTTCTGATACAATTGGCGACTTGAAAGTAGA...

LOC131013980
ATGTTCACAACACGGCCACCAACAGCTTCTCCCATTCAGAGAAGCTTTGTGGGGGTTGATTCGTTCAGTGTATTTCAGGAGATATATCTTCAAACCGACGATCCACGTGTCTCCAATATTATAAATTTTTCTGATACAATTGGCGACTTGAAAGTAGAGGCATCAGCTTCAGCCAAAGATGGGAAACGGATCCTCTTCCAGTTTGACAGAGCTGCCTTTTCCTTTAAATTTCTTCCCTTCAAAGTCCCCTACCCTGTACC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797904.1
MMRQEVERAVEKLEDVKGVPEPTGSTLIEGRWQLMFTTRPPTASPIQRSFVGVDSFSVFQEIYLQTDDPRVSNIINFSDTIGDLKVEASASAKDGKRILFQFDRAAFSFKFLPFKVPYPVPFRLLGDEAKGWLDTTYLSQSGNIRISRGNKGTTFVLQKQTEERQRLLSAISRGGPQVRQAIDKFVTVNQSTTKGEFELLEGEWLMIWSSQEVTESWIENASKGLMGKQIIKPNGQMKFLVDILFGLRFSMTGKYVKSGF...

XP_057797905.1
MFTTRPPTASPIQRSFVGVDSFSVFQEIYLQTDDPRVSNIINFSDTIGDLKVEASASAKDGKRILFQFDRAAFSFKFLPFKVPYPVPFRLLGDEAKGWLDTTYLSQSGNIRISRGNKGTTFVLQKQTEERQRLLSAISRGGPQVRQAIDKFVTVNQSTTKGEFELLEGEWLMIWSSQEVTESWIENASKGLMGKQIIKPNGQMKFLVDILFGLRFSMTGKYVKSGFNAYDVVMDDAAIVAGPYGIPAEMETKYTLQLLYG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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