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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001950`

染色体: Chr03 坐标: 27821385-27823583 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001950`
名称	SmilChr03G001950
描述	uncharacterized SmilChr03G001950
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	27821385 - 27823583 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018612`
GeneID	`131018612`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018612`
原始查询	`SmilChr03G001950`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=23.9; qcov=0.97; evalue=2.19e-07; confidence=weak
Rice	`Os02g0630250` - identity=33.7; qcov=0.343; evalue=5.89e-08; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018612

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803310.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803310.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803310.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803310.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803310.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:27821387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B81,C61
`Chr3:27821400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr3:27821401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr3:27821406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B91,D2,D6
`Chr3:27821429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B49,D2
`Chr3:27821429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,D2
`Chr3:27821470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B90
`Chr3:27821494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C14
`Chr3:27821509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C14
`Chr3:27821511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr3:27821536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B133,B62,B90,C19,C66,C67,C80,D5
`Chr3:27821543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C18,C45,C48,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803310.1

268 aa

134

268

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 3-76 aa PF13456 RVT_3 182-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803310.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	3	76	1.5e-11	45.5	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057803310.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	182	258	1.3e-09	38.8	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947327.1
ATGCGTCCTAGCTTTCCGACTGTCAATTGGGGTAAATGGATCTGGGCGCCTTTTATGCCTGTTCGCAGATCTATTGTTACTTGGAGGGTTGTTCTGGATCGTTTCCAGACGGCCAGTTCACTGCGTCGCCAGGGTTTTATGGGCCATGGTTGGTTCCCGCTTTCTAGAGAAGCTGGGGAGGATATTGATCACCTCTTTTGGGAGTGTGCGATTGCTCGACACGTTTGGAGCTCCCTTTTTTCTTGGTTTCACTTTGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018612
ATGCGTCCTAGCTTTCCGACTGTCAATTGGGGTAAATGGATCTGGGCGCCTTTTATGCCTGTTCGCAGATCTATTGTTACTTGGAGGGTTGTTCTGGATCGTTTCCAGACGGCCAGTTCACTGCGTCGCCAGGGTTTTATGGGCCATGGTTGGTTCCCGCTTTCTAGAGAAGCTGGGGAGGATATTGATCACCTCTTTTGGGAGTGTGCGATTGCTCGACACGTTTGGAGCTCCCTTTTTTCTTGGTTTCACTTTGATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803310.1
MRPSFPTVNWGKWIWAPFMPVRRSIVTWRVVLDRFQTASSLRRQGFMGHGWFPLSREAGEDIDHLFWECAIARHVWSSLFSWFHFDGSSILDIGSLVIWAMKVPASKQVVFVEAPIFDVALTIQVKAFILEAARFNLGEMANSVEELLILHGLGVPGKPRRPTSYIYVFWLPPPHLWWKINIDGYVHGSPPFIHAGGIIRDSSSVIGCFHFSAGRGWAFEAELFALIIALEHIVVHGWDYIWTETDCTYMVDLFRSRSDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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