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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001954`

染色体: Chr03 坐标: 27926021-27930458 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001954`
名称	SmilChr03G001954
描述	stromal 70 kDa heat shock-related protein, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	27926021 - 27930458 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014001`
GeneID	`131014001`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014001`
原始查询	`SmilChr03G001954`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stromal 70 kDa heat shock-related protein, chloroplastic
产物	stromal 70 kDa heat shock-related protein%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G49910` (cpHsc70-2) chloroplast heat shock protein 70-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835054] identity=83.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0244100` (OsHsp70CP2) - identity=84.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009507 (chloroplast); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0031072 (heat shock protein binding); GO:0034620 (cellular response to unfolded protein); GO:0042026 (protein refolding); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051085 (GO:0051085); GO:0051787 (misfolded protein binding); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00012 (HSP70); PF06723 (MreB_Mbl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014001

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057797921.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057797921.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057797921.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057797921.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797921.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:27926503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr3:27926702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,B98,C50
`Chr3:27927468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:27928275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B16,B2,C19
`Chr3:27928296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr3:27929006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,B98,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797921.1

703 aa

352

703

HSP70

MreB_Mbl

PF00012 HSP70 68-662 aa PF06723 MreB_Mbl 177-435 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797921.1`	Pfam	`PF00012`	HSP70	Family	68	662	1.9e-266	885.8	Hsp70 protein
`XP_057797921.1`	Pfam	`PF06723`	MreB_Mbl	Family	177	435	1.6e-19	70.6	MreB/Mbl protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941938.1
ATTATTTATGCCCCTACCAACCTAAACCCTCCTCTCTGCCCCTTCTCTTATCTATCTCCACCAAATTCTCAGTCTCACCTCTTTGGCTCTTTAGTCGTCGCCCCCAATTCCAATTCTGCCTAGGGTTTGCTCAAACAATTCGGCCTTCACATTTGATTTTTCGCAAACCCTAGATCGCAAAATGGCCTCCTCAACTGCTCAAATTCACGCTCTCGGCGCCGCTGCTCACTTCACTGCCGCGAACTCAACCAGAAATAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014001
ATGGCCTCCTCAACTGCTCAAATTCACGCTCTCGGCGCCGCTGCTCACTTCACTGCCGCGAACTCAACCAGAAATAATCCCAATAGAACGGTATTTCTTGGAGCCAGGCTCAACAGTAGCTCTATGCCCTTTGGATTGCATCTGAAGAGTAAGCATAGAAGCGGCCGCCGAGGCTCTGCTCTGCGCGTGGTGGCGGAGAAGGTTGTGGGGATTGACCTGGGCACGACCAATTCTGCCGTGGCGGCCATGGAGGGAGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797921.1
MASSTAQIHALGAAAHFTAANSTRNNPNRTVFLGARLNSSSMPFGLHLKSKHRSGRRGSALRVVAEKVVGIDLGTTNSAVAAMEGGKPTIVTNAEGQRTTPSVVAYTKNADRLVGQIAKRQAVVNPENTFFSVKRFIGRKMSEVDEESKQVSYNVVRDENGNVKLECPAIGKQFAAEEISAQVLRKLVDDASKFLNDKVTKAVVTVPAYFNDSQRTATKDAGRIAGLEVLRIINEPTAASLAYGFEKKSNETILVFDLGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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