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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001960`

染色体: Chr03 坐标: 28086689-28096713 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001960`
名称	SmilChr03G001960
描述	uncharacterized SmilChr03G001960
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	28086689 - 28096713 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014004`
GeneID	`131014004`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014004`
原始查询	`SmilChr03G001960`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fringe-like protein (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831121]; symbol=AT5G12460; hit=AT5G12460; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	fringe-like protein (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831121]; symbol=AT5G12460; hit=AT5G12460; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G12460` (AT5G12460) fringe-like protein (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831121] identity=44.9; qcov=0.868; evalue=2.17e-133; confidence=medium
Rice	`Os03g0269900` - identity=34.1; qcov=1.03; evalue=1.95e-83; confidence=low
GO	GO:0008375 (acetylglucosaminyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02434 (Fringe); PF04646 (DUF604)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014004

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057797923.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057797923.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797923.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797923.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797923.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:28087082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B97
`Chr3:28087376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:28087431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C36
`Chr3:28087616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:28094746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B97
`Chr3:28094777`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C61
`Chr3:28094777`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C61
`Chr3:28094821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr3:28095099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,C38,C71,D11
`Chr3:28096323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B80,B95,B98,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797923.1

477 aa

238

477

Fringe

DUF604

PF02434 Fringe 149-265 aa PF04646 DUF604 202-453 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797923.1`	Pfam	`PF02434`	Fringe	Domain	149	265	2.6e-08	34.1	Fringe-like
`XP_057797923.1`	Pfam	`PF04646`	DUF604	Family	202	453	1.4e-91	307.1	Protein of unknown function, DUF604

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941940.1
ATATAAATTGAAGGTAATCCCAGCTCTCATGATTTAGTCAAGCACCAATTTTTGTCAAAGGAAAAAAATGTCGTCGTCTCCAAAAATGGATGTTTCCGGCGGCCCATGCAAAACCCTTGCAATTCTGTTTGTAGTCTTTTACTTCATCTTCGTGGCCTTCTCCAATCAGTACCCCAACTGCCCAGCCTCCGCCGACTTCTTCTCTCCTTTCCTCAAACGGCAACCATTCTCACCCTCTACGGAGAAGGAAACACAATCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014004
ATGTCGTCGTCTCCAAAAATGGATGTTTCCGGCGGCCCATGCAAAACCCTTGCAATTCTGTTTGTAGTCTTTTACTTCATCTTCGTGGCCTTCTCCAATCAGTACCCCAACTGCCCAGCCTCCGCCGACTTCTTCTCTCCTTTCCTCAAACGGCAACCATTCTCACCCTCTACGGAGAAGGAAACACAATCCTCGGCAACTCCGACCACGCTCGAGCACCTCGTATTCGGCCTCGTCGGGTCGGAGCGGGCGTGGCACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797923.1
MSSSPKMDVSGGPCKTLAILFVVFYFIFVAFSNQYPNCPASADFFSPFLKRQPFSPSTEKETQSSATPTTLEHLVFGLVGSERAWHHRKAYIESWWRPNVTRGFLFLDTAPTGDLLPWSPASPPYRISDDITKLLHKTNVVAQRIIHAIMEVYREDHENLRWLVMGDDDSIFVVDNIVHILAGYDHTKYYYFGGQSEFILSNYWFSFSQGFGGAGFIMSYPLAKLVAADMEKCLLRYRHLNAADRTTMSCIADIGVNLTP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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