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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001964`

染色体: Chr03 坐标: 28148309-28152659 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001964`
名称	SmilChr03G001964
描述	monooxygenase 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	28148309 - 28152659 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014007`
GeneID	`131014007`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014007`
原始查询	`SmilChr03G001964`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	monooxygenase 2-like
产物	monooxygenase 2-like
Arabidopsis	`AT5G05320` (AT5G05320) FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830414] identity=44; qcov=0.903; evalue=1.5e-67; confidence=medium
Rice	`Os03g0154100` - identity=48; qcov=0.861; evalue=1.16e-72; confidence=high
GO	GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01494 (FAD_binding_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014007

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057797925.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057797925.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057797925.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057797928.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797925.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:28149805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr3:28149871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,C21
`Chr3:28149982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:28150142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,C44,D1
`Chr3:28150145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:28150184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C23,C56,C73
`Chr3:28150308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B6,C5,C65
`Chr3:28150311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B52,C54
`Chr3:28150317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr3:28150384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B123,B131,B99,C21
`Chr3:28150404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C35,C44,C5,C62,D9
`Chr3:28150423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797925.1

264 aa

132

264

FAD_binding_3

PF01494 FAD_binding_3 25-234 aa

XP_057797926.1

264 aa

132

264

FAD_binding_3

PF01494 FAD_binding_3 25-234 aa

XP_057797927.1

264 aa

132

264

FAD_binding_3

PF01494 FAD_binding_3 25-234 aa

XP_057797928.1

259 aa

130

259

FAD_binding_3

PF01494 FAD_binding_3 25-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797925.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	25	234	2.2e-06	27.9	FAD binding domain
`XP_057797926.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	25	234	2.2e-06	27.9	FAD binding domain
`XP_057797927.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	25	234	2.2e-06	27.9	FAD binding domain
`XP_057797928.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	25	233	2.2e-06	27.9	FAD binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941944.1
TACAAAAGTTTACATACATAACAGTGCATAGATAACGGTTTTTTTCAAAAACCGTTATGTATGAGCGCACTTTTAGGAATAGATAACAGTTTTGCAAAAATCCGTTATCTATGTAGTGTTGTCTATATGCATAGATAACGGTTTCAATTAATTCGTTATGTTTTTGCGTTATCTATTAGTTACATACATAACGGTATTACAAACCGTTAAGCCGACCGTTATCTATGTGCGTATTTTTGAACTCTTAGATAACGATTATT...

XM_057941942.1
AATTAAATAATTTAAAAATATTGTATAATTCTATCTCTCATCTCTTCCCCAAATCTGGAGAAAGAAGGAGTTGACTGCTGCCGCGTCGCTCCGACAGTGGTTGCCCGACGCCACCGCCGCTGAAGCAGCGCAGCCTGGAGACCTCCAGCTACCGCCTCGCTCGGAGCCGCCTCCGACCTCGCCGACCCTCAGCTGCGCGACTGCACCGCGTGACCGGTCTCCAAAAGATCCTACTGAATTCCTTCACACGATGAGGGCTC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131014007
ATGCTGCTGAAACTGATTCGCTTTGATGATTATGAGCTAAACTTTTTAAGACTGTTGCTGTTTGATAATAGTAGATTGGGAATTCGAAGCGTAGTTGTGGAGTCAGCAGATAGCTTGAGAACTTCGGGATTTGCTTTAGGAATTTTAGCAAATGGTTGGAGGGCACTGGATGCTATTGGCGTAGGCGACATACTTCGCGCAAAACACCACAAACTTAGCAGAATTGTGACTACATCGGTTAACTCTGGGATTCAGACTGC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057797925.1
MLLKLIRFDDYELNFLRLLLFDNSRLGIRSVVVESADSLRTSGFALGILANGWRALDAIGVGDILRAKHHKLSRIVTTSVNSGIQTAELPFRASHSQDDLESRCVSRRVLLETLENELPRGTIRYSSKVVHIQIEDRVESIHLSDGTVLKTKVLIGCDGVNSVVSKFLGFSKPVYAGRAAVRGFVYFKDGHAFEPKLMQLFGKGVRFGVIPCDDYTVYWFFTFSPSSQEKEMVEDPAKLKLFMLSKLGKVSDEIRRVFEE...

XP_057797926.1
MLLKLIRFDDYELNFLRLLLFDNSRLGIRSVVVESADSLRTSGFALGILANGWRALDAIGVGDILRAKHHKLSRIVTTSVNSGIQTAELPFRASHSQDDLESRCVSRRVLLETLENELPRGTIRYSSKVVHIQIEDRVESIHLSDGTVLKTKVLIGCDGVNSVVSKFLGFSKPVYAGRAAVRGFVYFKDGHAFEPKLMQLFGKGVRFGVIPCDDYTVYWFFTFSPSSQEKEMVEDPAKLKLFMLSKLGKVSDEIRRVFEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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