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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001972`

染色体: Chr03 坐标: 28415955-28416551 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001972`
名称	SmilChr03G001972
描述	uncharacterized SmilChr03G001972
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	28415955 - 28416551 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018621`
GeneID	`131018621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018621`
原始查询	`SmilChr03G001972`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922371]; symbol=AT5G65005; hit=AT5G65005; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922371]; symbol=AT5G65005; hit=AT5G65005; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G65005` (AT5G65005) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922371] identity=24.4; qcov=0.601; evalue=6.81e-06; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803317.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803317.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803317.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803317.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803317.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:28416036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B135,B7,D11
`Chr3:28416068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B94,B95,B96,C18
`Chr3:28416070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,C28,D7
`Chr3:28416075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr3:28416082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B120,B18
`Chr3:28416087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	B114,B119,B18,B25,B6,B70,B94,C10,C11,C22,C27,C47,C54,C67,C69,C70,D8
`Chr3:28416118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:28416142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr3:28416147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C25,C70,C71
`Chr3:28416150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C4,C40
`Chr3:28416153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B23
`Chr3:28416156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803317.1

198 aa

198

RVT_3

PF13456 RVT_3 46-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803317.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	46	164	4.4e-18	66.1	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947334.1
ATGGTGAAATGGGCTATACAGCTTGGAGAATACGAGGTCGAGTTTGAGCCGCGCACTACCAGTAGAGCCCAGGCACTAGCGGATTTCATTCAAGAAGCAACAAGGTGGCCTATGAGGGGACCGTGGGCATCACAGGTTGATGGGTCGGTCACTAAAGAAGGATGCGGGGTGGGAATCTACATCACCTCGCCCGAAGGGGAAGTCTATCAATTCGCTATCAAGTTTGAAGATAAGTTATCCAATAACGAAGCCGAATATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018621
ATGGTGAAATGGGCTATACAGCTTGGAGAATACGAGGTCGAGTTTGAGCCGCGCACTACCAGTAGAGCCCAGGCACTAGCGGATTTCATTCAAGAAGCAACAAGGTGGCCTATGAGGGGACCGTGGGCATCACAGGTTGATGGGTCGGTCACTAAAGAAGGATGCGGGGTGGGAATCTACATCACCTCGCCCGAAGGGGAAGTCTATCAATTCGCTATCAAGTTTGAAGATAAGTTATCCAATAACGAAGCCGAATATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803317.1
MVKWAIQLGEYEVEFEPRTTSRAQALADFIQEATRWPMRGPWASQVDGSVTKEGCGVGIYITSPEGEVYQFAIKFEDKLSNNEAEYEAVLRAAHILRELIADNAVIKTDSQLVAQQLTGGCGVKEERMKHYFDKVQEIGKKFEKFEIQQVSREENQRADLLARVASAVEQTWSEDITLVFEPKREVVAQVYNIETKDD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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