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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001983`

染色体: Chr03 坐标: 28986595-28993788 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001983`
名称	SmilChr03G001983
描述	cyclic nucleotide-gated ion channel 4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	28986595 - 28993788 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014012`
GeneID	`131014012`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014012`
原始查询	`SmilChr03G001983`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclic nucleotide-gated ion channel 4-like
产物	cyclic nucleotide-gated ion channel 4-like
Arabidopsis	`AT5G54250` (CNGC4) cyclic nucleotide-gated cation channel 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835513] identity=76.5; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0502000` (OsCNGC9) - identity=66.5; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00027 (cNMP_binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014012

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797932.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797932.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797932.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797932.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797932.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:28986731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:28986864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B97
`Chr3:28987026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,C24,C42,C6
`Chr3:28987077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:28987082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr3:28987125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B80,B95,B98,C50
`Chr3:28987157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr3:28987157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:28987357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr3:28987366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr3:28987401`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B41
`Chr3:28987401`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797932.1

654 aa

327

654

cNMP_binding

PF00027 cNMP_binding 478-565 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797932.1`	Pfam	`PF00027`	cNMP_binding	Domain	478	565	8.8e-07	29.5	Cyclic nucleotide-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941949.1
ATGCCGGTACGCCCTTTGTCGTTTGATGCTGCAATAAAATAGTGCATATGACATACCTATACATACAAATGTATATATGCATGTGTAGGTGTGTGTGTGTAAATGTCGCTAACATAAATAATTGATGGGCTAAAGAACAAAAACGACGAAGCTGCATGGAACCTGTGTCGTTCGAACTTATTTGAGAATAATATCAGTTTGGCGTCATTTTGCTGCCCTACTCAACTGTCTGGACTACGCACTTTGTCTCACCACTCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014012
ATGCCGAATTGCGAGCAAGAAGGCTTCCACTACAACTACAGCAATGACGAGAGTGATTCCGACGAAGCAGAGGAGGAGGAGGAGGTAATTAATCCGGCGAGCTTGGACGGCGGTTGCTGTTCCCGACGCCGCGAGTGGCGGTTCTGGGGTAAGGTTTTGGACCCTAGAGCGACGTGGGTGCAGGAATGGAACAGATTGTTCCTCTTAGTTTGCGCGGTGGGGCTCTTCGTGGACCCCTTGTTCTTCTACACCCTCTCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797932.1
MPNCEQEGFHYNYSNDESDSDEAEEEEEVINPASLDGGCCSRRREWRFWGKVLDPRATWVQEWNRLFLLVCAVGLFVDPLFFYTLSISESCMCLFVDGWFAVTVTVLRCMIDALHLWNVWLQFKMNRCPDRRMHDPATVALKYFKSRKGFTFDLFVILPLPQIVIWVVIPKLLERGWTTVVMTVLLVMFVFQYLPKIYHSVCLLRRMQNFSGYIFGTVWWGIALNMIAYFVASHAVGACWYLLGIQRAAKCLKEQCMVTK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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