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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001988`

染色体: Chr03 坐标: 29124350-29131443 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001988`
名称	SmilChr03G001988
描述	uncharacterized SmilChr03G001988
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	29124350 - 29131443 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014018`
GeneID	`131014018`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014018`
原始查询	`SmilChr03G001988`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF538 family protein (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832079]; symbol=AT5G19590; hit=AT5G19590; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DUF538 family protein (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832079]; symbol=AT5G19590; hit=AT5G19590; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G19590` (AT5G19590) DUF538 family protein (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832079] identity=64; qcov=0.85; evalue=9.58e-56; confidence=high
Rice	`Os01g0595400` - identity=52.9; qcov=0.823; evalue=7.99e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04398 (DUF538)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014018

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057797938.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057797938.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797938.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797938.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797938.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:29130865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B114,B25,B88
`Chr3:29130980`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B24
`Chr3:29130980`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B24
`Chr3:29131055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797938.1

147 aa

147

DUF538

PF04398 DUF538 28-134 aa

XP_057797939.1

147 aa

147

DUF538

PF04398 DUF538 28-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797938.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	28	134	1.1e-28	100.6	Protein of unknown function, DUF538
`XP_057797939.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	28	134	1.1e-28	100.6	Protein of unknown function, DUF538

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941956.1
ATTTCAACTTACTTATAAACACATCCGATGTGATGATGTGATTATAAATTGGAGGTTTGGAGTTCCGGGTACAGTCGTGGCAGTTAGATATAGAATATGAGAATGCGTCATCTTGTTGGATATTTCAGCACCACTCCCAACTAAATAATTAGCCTACAACTTGAACAATAATTAGCCACACTCAACTCTTCTCAGCCTCCATTAATGGCGATATCTCCAGTTCTCTTCATCTTGTGCCTCTCTCTCCTCGCCGCCGCGTC...

XM_057941955.1
CGATGTGATGATGTGATTATAAATTGGAGGTTTGGAGTTCCGGGTACAGTCGTGGCAGTTAGATATAGAATATGAGAATGCGTCATCTTGTTGGATATTTCAGCACCACTCCCAACTAAATAATTAGCCTACAACTTGAACAATAATTAGCCACACTCAACTCTTCTCAGCCTCCATTAATGGCGATATCTCCAGTTCTCTTCATCTTGTGCCTCTCTCTCCTCGCCGCCGCGTCAAAGAGGTCCGAGGCGACCTCCGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014018
ATGGCGATATCTCCAGTTCTCTTCATCTTGTGCCTCTCTCTCCTCGCCGCCGCGTCAAAGAGGTCCGAGGCGACCTCCGCCCATGACGAATTGGTGAAGTACGGTTTCCCCGTCGGCCTTCTCCCTGCCGACATTGAGTCCTACACGCTTAACCACACCTCCGGCGCCTTCTCAGTGCGGCTTGGAAATAATTGCCGCGTGACGCTGCCGCCGGACAACTACTTGGCCTCCTACTCGAAGCGAATTACCGGCAAGATCGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797938.1
MAISPVLFILCLSLLAAASKRSEATSAHDELVKYGFPVGLLPADIESYTLNHTSGAFSVRLGNNCRVTLPPDNYLASYSKRITGKIVGNRIAELDGISVRAFFKWWGITGIRSSGQDLVFEVGVVTAKYPSKNFDESPPCEGRRSSS

XP_057797939.1
MAISPVLFILCLSLLAAASKRSEATSAHDELVKYGFPVGLLPADIESYTLNHTSGAFSVRLGNNCRVTLPPDNYLASYSKRITGKIVGNRIAELDGISVRAFFKWWGITGIRSSGQDLVFEVGVVTAKYPSKNFDESPPCEGRRSSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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