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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001994`

染色体: Chr03 坐标: 29419250-29423097 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001994`
名称	SmilChr03G001994
描述	uncharacterized SmilChr03G001994
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	29419250 - 29423097 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014015`
GeneID	`131014015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014015`
原始查询	`SmilChr03G001994`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme 37 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822045]; symbol=UBC37; hit=AT3G24515; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	ubiquitin-conjugating enzyme 37 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822045]; symbol=UBC37; hit=AT3G24515; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G24515` (UBC37) ubiquitin-conjugating enzyme 37 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822045] identity=77.1; qcov=0.286; evalue=1.69e-88; confidence=weak
Rice	`Os01g0605300` (OsUBC48) - identity=63.8; qcov=0.381; evalue=2.49e-81; confidence=low
GO	GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005634 (nucleus); GO:0006974 (DNA damage response); GO:0061631 (ubiquitin conjugating enzyme activity)
KEGG	smil03460 (Fanconi anemia pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797935.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057797935.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797935.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797935.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797935.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:29420077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B31
`Chr3:29420182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:29420413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B28,B30,B55,B84
`Chr3:29420542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B86
`Chr3:29420572`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr3:29420572`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr3:29420574`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr3:29420574`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr3:29420946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797935.1

580 aa

290

580

UQ_con

PF00179 UQ_con 12-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797935.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	12	159	3.5e-40	137.6	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941952.1
CACTCCACTTCACCAACGTAAATGGAAGTGTCAAATGAAAATTCAAATCTCAGTTGTACGAACCCTAACCCGCCCAACAATTCGAGAACGGTGTATTTAAAAAGAGAAACAAAAACAATTTGAAAACGGTTGACAGAGAAAATGAAATGCACTGCTAAACGAAGTTGAGTTGTAAGAGTTGAATGGCTATGGCGCAGGCAGCCAGATTGAACCTGCGAATGCAAAAGGAACTCAAACTCCTACTTACTGATCCACCTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014015
ATGGCTATGGCGCAGGCAGCCAGATTGAACCTGCGAATGCAAAAGGAACTCAAACTCCTACTTACTGATCCACCTCCAGGCGCCACTTTCCCTACTCTTTCCGACCACCACCACGCCGGCGGCGACTCCTCCCTCACCTCCATCGATGCGCTGCTTCAAGGACCTGAGGGAACAGTATACTCTAATGGCGTCTTCAAAATTAAGATCCAAATACCCGAAAGGTACCCTTTTCAGCCTCCGATTGTGACTTTTGCAACACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797935.1
MAMAQAARLNLRMQKELKLLLTDPPPGATFPTLSDHHHAGGDSSLTSIDALLQGPEGTVYSNGVFKIKIQIPERYPFQPPIVTFATPIYHPNIDNGGRICLDILNLPPKGMWQPSLNISTVLTSIGLLLSEPNPDDGLMHEASRDYKYNRQAFDQNARSMTEKYAQAGVADMARGENGVQTHTSQSTSQTKMEGSVAPICISEHRKLSLESLGCSNNERNNCEEMSKVAIHNSSKNHIGIGPLKEASKDSFTHTWISGKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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