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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002003`

染色体: Chr03 坐标: 29852820-29853405 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002003`
名称	SmilChr03G002003
描述	uncharacterized SmilChr03G002003
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	29852820 - 29853405 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014038`
GeneID	`131014038`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014038`
原始查询	`SmilChr03G002003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0256300` - identity=34.3; qcov=0.45; evalue=1.47e-10; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014038

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057797946.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057797946.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797946.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797946.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797946.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:29852828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C1
`Chr3:29852841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr3:29852866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C32
`Chr3:29852898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B125,B77
`Chr3:29852899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B3,C2
`Chr3:29852964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,C31,C58
`Chr3:29852967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C41
`Chr3:29852996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B35,B46,B48
`Chr3:29852998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C65,C80
`Chr3:29853093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C12,C65
`Chr3:29853188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B83,C32,C68
`Chr3:29853314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797946.1

149 aa

149

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 30-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797946.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	30	75	3.4e-08	34.2	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941963.1
ATGAGTTTCAATTCAGTCTCCGGTGGTTGTGGGTCGGGATCTTCGCGTGGTGGACGCCAGTTTCAAGACCTTCAAAATCCAAGGTTTTGTGAGTGCCACACTGATGGAAAAAGGACGAGAGCTGTGATAATGACCTCATGGACCGACGAAAATCCCGGTAGGAGATTTTATGGGTGCCGGAATTGGAAGACGAAGAATTGTGGTTTGTTTGATTGGATTGACGAACCAATGACTGAAAGAGCTAAAGACATTATCAACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014038
ATGAGTTTCAATTCAGTCTCCGGTGGTTGTGGGTCGGGATCTTCGCGTGGTGGACGCCAGTTTCAAGACCTTCAAAATCCAAGGTTTTGTGAGTGCCACACTGATGGAAAAAGGACGAGAGCTGTGATAATGACCTCATGGACCGACGAAAATCCCGGTAGGAGATTTTATGGGTGCCGGAATTGGAAGACGAAGAATTGTGGTTTGTTTGATTGGATTGACGAACCAATGACTGAAAGAGCTAAAGACATTATCAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797946.1
MSFNSVSGGCGSGSSRGGRQFQDLQNPRFCECHTDGKRTRAVIMTSWTDENPGRRFYGCRNWKTKNCGLFDWIDEPMTERAKDIINELKIMKNKESSNSEPMDVEMEFAKIWNVIQMLKEDSIKNMKKTRLVTTMLIVSWMCMACYALV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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