当前解析结果
SmilChr03G002036| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002036 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002036 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002036 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 30721295 - 30721639 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018647 |
|---|---|
| GeneID | 131018647 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018647 |
| 原始查询 | SmilChr03G002036 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018647 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803346.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057803346.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803346.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803346.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803346.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:30721337 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B114,B25,B88 |
Chr3:30721360 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | B102,B22,B26,B53,B58,B7,B83,C29,C59,C77,C79 |
Chr3:30721377 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B35,B64,C24,D11 |
Chr3:30721411 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B80,B95,B98,C50 |
Chr3:30721433 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 27 | A1,B104,B108,B114,B119,B125,B17,B25,B26,B27,B42,B60,B7,B8,B88,C11,C13,C16,C20,C21,C42,C52,C59,C68,C72,C9,D8 |
Chr3:30721434 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B133,B42,B43,B90,B92 |
Chr3:30721441 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B54,B86 |
Chr3:30721471 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B35,B64,C24,D11 |
Chr3:30721471 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B35,B64,C24,D11 |
Chr3:30721492 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B65 |
Chr3:30721529 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B34,B80,B95,B97,C50 |
Chr3:30721564 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,B41,C3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。