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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002051`

染色体: Chr03 坐标: 31060250-31060645 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002051`
名称	SmilChr03G002051
描述	probable histone H2B.1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	31060250 - 31060645 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018649`
GeneID	`131018649`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018649`
原始查询	`SmilChr03G002051`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable histone H2B.1
产物	probable histone H2B.1
Arabidopsis	`AT3G45980` (HTB9) Histone superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823741] identity=65.1; qcov=0.832; evalue=4.42e-32; confidence=medium
Rice	`Os03g0279000` (H2B1) - identity=59.6; qcov=0.718; evalue=2.63e-24; confidence=medium
GO	GO:0000786 (nucleosome); GO:0003677 (DNA binding); GO:0006334 (nucleosome assembly); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00125 (Histone)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018649

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803348.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057803348.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057803348.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057803348.1`
5	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.20000	`XP_057803348.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:31060323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B9,C26
`Chr3:31060369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B106,B64,B73
`Chr3:31060377`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A10,A20,A24,B113,B126,B130,B137,B34,B40,B82,C50,C52,C60,C62,D10
`Chr3:31060413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B138,B31,B33
`Chr3:31060432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,C1,C79,C85
`Chr3:31060522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A1,A13,A25,A8,B100,B102,B11,B110,B115,B120,B25,B34,B47,B8,C16,C21,C41,C47,C76,D1
`Chr3:31060540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:31060552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A10,A18,A21,A9,B12,B14,B2,B28,B32,B47,B53,B64,B79,B82,B86,B99,C13,C18,C30,C37,C59,C6,C60,C73,C75,C87,D1,D10,D4,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803348.1

131 aa

131

Histone

PF00125 Histone 39-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803348.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	39	94	2.4e-07	31.8	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947365.1
ATGGCAGCCAAAAGAGAAAATAAGCTCGCCGAGAAGAAACCCGCCGCCGTGAAATCTCCGGCGGAGAAGAAGCCCAAGGCCGGGAAGAAGCTACAGAAGGAGGCCGGCGTCGCCGCCGAAAACCAGAAGAAGAAGCGGAACAAGAAGAGCTTGGAGACCTACATCTTCATGGTGCTGAAGCAGGTGCACCCCGACATCGGGTTCTCGAGCACTGTCATGGGCATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018649
ATGGCAGCCAAAAGAGAAAATAAGCTCGCCGAGAAGAAACCCGCCGCCGTGAAATCTCCGGCGGAGAAGAAGCCCAAGGCCGGGAAGAAGCTACAGAAGGAGGCCGGCGTCGCCGCCGAAAACCAGAAGAAGAAGCGGAACAAGAAGAGCTTGGAGACCTACATCTTCATGGTGCTGAAGCAGGTGCACCCCGACATCGGGTTCTCGAGCACTGTCATGGGCATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803348.1
MAAKRENKLAEKKPAAVKSPAEKKPKAGKKLQKEAGVAAENQKKKRNKKSLETYIFMVLKQVHPDIGFSSTVMGIMNSFINDIFENLVQESSRLGRCIRSRPSHHQNSTLHKPREIERTDPSHHQPGAKAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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