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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002070`

染色体: Chr03 坐标: 31603473-31605806 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002070`
名称	SmilChr03G002070
描述	uncharacterized SmilChr03G002070
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	31603473 - 31605806 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018655`
GeneID	`131018655`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018655`
原始查询	`SmilChr03G002070`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=44.2; qcov=0.592; evalue=3.9e-118; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018655

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803354.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803354.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803354.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803354.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803354.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:31603481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B41,C18,C54
`Chr3:31603487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B5
`Chr3:31603590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,C20,C42
`Chr3:31603594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C56,C67
`Chr3:31603605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:31603699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B129,B94
`Chr3:31603705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:31603773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr3:31603803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	68	A1,A11,A15,A24,B102,B108,B111,B113,B118,B12,B120,B127,B129,B13,B131,B134,B14,B17,B20,B25,B26,B27,B29,B31,B37,B40,B41,B45,B47,B48,B51,B65,B69,B78,B79,B86,B87,B9,B95,B98,C11,C12,C13,C18,C2,C24,C26,C28,C29,C31,C38,C41,C50,C51,C55,C56,C59,C6,C69,C7,C73,C78,C81,D1,D4,D6,D7,D9
`Chr3:31603804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr3:31603809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B77,C51
`Chr3:31603809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803354.1

726 aa

363

726

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF02992 Transposase_21 1-141 aa PF13960 DUF4218 324-428 aa PF13952 DUF4216 599-666 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803354.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	1	141	1.2e-55	188.7	Transposase family tnp2
`XP_057803354.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	324	428	1.7e-44	151.0	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057803354.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	599	666	1.3e-19	71.2	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947371.1
ATGATGCTCACTTTGTTGGTTTCTGGTCCACACCAACCAGGAAATGATATTGATGTTTATCTGGCGCCATTGATTGATGATTTGAAACAATTGTGGGAAGTAGGTGCTGAGATATATGATGCATATCACAAAGAAAATTTCATGCTCCGAGCTGTCTTACTTTGGACAATCAATGATTTTCCTGCATATGGCAATTTATCAGGGAGCAAAGTTAAAGGGTATTTTGCATGTCCTGTTTGTGCTGACCAAACTTATGCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018655
ATGATGCTCACTTTGTTGGTTTCTGGTCCACACCAACCAGGAAATGATATTGATGTTTATCTGGCGCCATTGATTGATGATTTGAAACAATTGTGGGAAGTAGGTGCTGAGATATATGATGCATATCACAAAGAAAATTTCATGCTCCGAGCTGTCTTACTTTGGACAATCAATGATTTTCCTGCATATGGCAATTTATCAGGGAGCAAAGTTAAAGGGTATTTTGCATGTCCTGTTTGTGCTGACCAAACTTATGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803354.1
MMLTLLVSGPHQPGNDIDVYLAPLIDDLKQLWEVGAEIYDAYHKENFMLRAVLLWTINDFPAYGNLSGSKVKGYFACPVCADQTYAKNLKHSRKMSYTGHRRFLPDHHPYRRQKKAFNGKNELGPTPNILSGSEVFERVENINCVWGKKSKKSQSKGADDKSAWKKKSIFFELEYWKHLHIRHCLDVMHIEKNVCESLFGTLLNIPGKTKDGVKARLDLADMGLRNELAPMIGEKRTYLPPACYTLSKAEKRQVCAFFGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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