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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002081`

染色体: Chr03 坐标: 32014229-32018005 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002081`
名称	SmilChr03G002081
描述	MND1-interacting protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	32014229 - 32018005 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014064`
GeneID	`131014064`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014064`
原始查询	`SmilChr03G002081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MND1-interacting protein 1-like
产物	MND1-interacting protein 1-like
Arabidopsis	`AT2G35330` (AT2G35330) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818100] identity=58.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0141500` - identity=35.2; qcov=0.521; evalue=6.86e-69; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13920 (zf-C3HC4_3); PF20235 (PIR2-like_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014064

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797968.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057797968.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057797968.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797968.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797968.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:32016034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B80,B95,B98,C50
`Chr3:32016065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B126,B33,C12
`Chr3:32016092`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B133
`Chr3:32016092`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B133
`Chr3:32016094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B133
`Chr3:32016094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr3:32016239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B64,B68,B76,C41,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797968.1

737 aa

368

737

PIR2-like_helical

zf-C3HC4_3

PF20235 PIR2-like_helical 93-205 aa PF13920 zf-C3HC4_3 680-728 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797968.1`	Pfam	`PF20235`	PIR2-like_helical	Domain	93	205	1.5e-27	96.8	PIR2-like, helical domain
`XP_057797968.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	680	728	5.7e-13	49.2	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941985.1
AGCCCCACCCATTTTGGCAGCTGCTACAAATTACAACATCCTAAAGCATACCCTCCACCACCAACACTACCGCCAAACAACAAATCTCTAACACACTAATCTTGATCGGCGGCTCGCCGGAATCATCATTTCATCGGGTTATTGTTATTTGTTAATTTTGATTGATTGGGGTATTTGGTGTGATGGGCTGTACTGTTAGAGAGAAACATATCCGTACTAATCGGAGGACCCGATCGGCAAAGCCCGAATCGGATCATTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014064
ATGGGCTGTACTGTTAGAGAGAAACATATCCGTACTAATCGGAGGACCCGATCGGCAAAGCCCGAATCGGATCATTCCGGCACCAGTAACACAAATGGTAATGTAGATAAATCGGGGAATTTGAAACCGGGGGTTAAACCTAAAAATTACCACATGGCTCTGAATGCCTTGAAGCAGAACCCAATGTTGATGCCGCTTGTAAATGCGAGCTCTGTGTTTGAGGAAAACGGGTGGGGGTACTGCACGGAGGAACAGTTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797968.1
MGCTVREKHIRTNRRTRSAKPESDHSGTSNTNGNVDKSGNLKPGVKPKNYHMALNALKQNPMLMPLVNASSVFEENGWGYCTEEQLEEILLKNLEFLYSEAINKLVGLGYDEEVALKAILRNGHCYGGMDVLTNILHNSLAYLNSGGSSGGNGEEPEPSFADLRQLEEYSLAGMVCLLQQVKPHLTKGDAMWCLLMSDLHVGRASVMEVPVLPSPSGNGTSSSNSASGSGIEGVSTSGGTSPEGVASNGGPVGVAPALCR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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