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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002086`

染色体: Chr03 坐标: 32138411-32140303 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002086`
名称	SmilChr03G002086
描述	uncharacterized SmilChr03G002086
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	32138411 - 32140303 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018662`
GeneID	`131018662`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018662`
原始查询	`SmilChr03G002086`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=37.7; qcov=0.11; evalue=2.19e-06; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018662

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803359.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803359.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803359.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057803359.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057803359.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:32138413`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A5,B12,C12
`Chr3:32138413`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A5,B12,C12
`Chr3:32138427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C23
`Chr3:32138441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	77	A1,A15,A2,A21,A22,A3,A9,B1,B104,B106,B11,B112,B115,B117,B122,B123,B129,B131,B132,B140,B19,B2,B20,B26,B3,B38,B39,B4,B47,B59,B64,B66,B69,B73,B74,B75,B78,B82,B83,B85,B89,B9,B90,B92,B94,B98,B99,C1,C12,C16,C18,C2,C21,C22,C24,C27,C3,C33,C41,C42,C44,C45,C47,C48,C51,C56,C58,C59,C6,C60,C77,C78,C79,C82,C85,C86,D4
`Chr3:32138475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:32138476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr3:32138483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B111,C40
`Chr3:32138483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C40
`Chr3:32138484`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C29
`Chr3:32138484`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C29
`Chr3:32138485`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	49	A11,A20,A21,A5,A9,B111,B122,B123,B125,B129,B13,B132,B138,B2,B32,B36,B37,B40,B44,B46,B49,B52,B54,B58,B60,B64,B66,B67,B7,B78,B80,B84,B93,B97,C11,C13,C19,C23,C28,C37,C4,C40,C46,C52,C68,C73,C87,D4,D7
`Chr3:32138487`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	47	A11,A20,A21,A5,A9,B111,B122,B123,B125,B129,B132,B138,B2,B32,B36,B37,B40,B44,B46,B49,B52,B54,B58,B60,B64,B66,B67,B7,B80,B84,B93,B97,C11,C13,C19,C23,C28,C29,C37,C4,C40,C46,C68,C73,C87,D4,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947376.1
ATGCCCGGGGAGGACCCTCAAAGGCACCTTCAGGATTTTGAGATAGCATGTGGAACAGTGCGCACCGCAAGCCAAACATTTGGTGAATACATCCGACTCTTTACTTTTCCGTTCTCTCTATTAGGAGCGAGGGAGTGGCTGTACGATTTGCCCGAAGGAAGCATTCGGACCTGGCAGGAGTTGCAGAGCAAGTTCTTGGAGAAGTATTTTCCAGCAGCCCGAATCCAGAATTTGAGGACCCGGATAAGCAATATCAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018662
ATGCCCGGGGAGGACCCTCAAAGGCACCTTCAGGATTTTGAGATAGCATGTGGAACAGTGCGCACCGCAAGCCAAACATTTGGTGAATACATCCGACTCTTTACTTTTCCGTTCTCTCTATTAGGAGCGAGGGAGTGGCTGTACGATTTGCCCGAAGGAAGCATTCGGACCTGGCAGGAGTTGCAGAGCAAGTTCTTGGAGAAGTATTTTCCAGCAGCCCGAATCCAGAATTTGAGGACCCGGATAAGCAATATCAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803359.1
MPGEDPQRHLQDFEIACGTVRTASQTFGEYIRLFTFPFSLLGAREWLYDLPEGSIRTWQELQSKFLEKYFPAARIQNLRTRISNIKMGSGEILYEYWGRFKQMLAKCPQHQISDHDLIRYFVRGLRRQDRQWLHAACGGSILKKSAAEAFKLIADMAEESRDEEGTIVRNAPTPNPSAQDDNLDKLCNMFEKFMTNQGASNQGAPNTRKPVKTCQLCMANSHATDECPQLFEDEEINAIGKQPRGNNGGQHQKPFEPYRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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