Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002091`

染色体: Chr03 坐标: 32188659-32197066 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002091`
名称	SmilChr03G002091
描述	subtilisin-like protease SBT6.1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	32188659 - 32197066 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014087`
GeneID	`131014087`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014087`
原始查询	`SmilChr03G002091`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT6.1
产物	subtilisin-like protease SBT6.1
Arabidopsis	`AT5G19660` (S1P) SITE-1 protease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832086] identity=73.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0163500` (OsSub49) - identity=65.2; qcov=0.661; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF23001 (MBTP1_N); PF23090 (MBTPS1_4th); PF23094 (MBTPS1_3rd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014087

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057797996.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797996.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797996.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797996.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:32196988`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B81
`Chr3:32196988`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797996.1

1025 aa

512

1025

MBTP1_N

Peptidase_S8

MBTPS1_3rd

MBTPS1_4th

PF23001 MBTP1_N 43-114 aa PF00082 Peptidase_S8 192-444 aa PF23094 MBTPS1_3rd 472-600 aa PF23090 MBTPS1_4th 601-872 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797996.1`	Pfam	`PF23001`	MBTP1_N	Domain	43	114	7e-14	52.6	Membrane-bound Site-1 Protease Family N-terminal domain
`XP_057797996.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	192	444	4.8e-41	141.7	Subtilase family
`XP_057797996.1`	Pfam	`PF23094`	MBTPS1_3rd	Domain	472	600	1.8e-52	177.2	MBTPS1, third Ig-like domain
`XP_057797996.1`	Pfam	`PF23090`	MBTPS1_4th	Domain	601	872	1.1e-143	478.4	MBTPS1, fourth GATase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942013.1
TAGTATCTCCAATAGAAAGTAGTCTGTTTCTCTCGTGTTGCCTCGTTAGCCAGGTTTGATTTCTATACATTCCGCCGAATCATCAAGGACCCAATTTTCCCCATGCGGGTTCCACCGCCATGAGCCGCCGCCTCACCTCCCTAACGGCTTTCATTTTCCTTGTGCTTTCTTACCACGCCTACCGTTTCCCCAATCGCAACCCGACCTCCACTCCCTCAGTCATCCCACCGGAGAATTCCACCGCCACTAACCACATAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014087
ATGAGCCGCCGCCTCACCTCCCTAACGGCTTTCATTTTCCTTGTGCTTTCTTACCACGCCTACCGTTTCCCCAATCGCAACCCGACCTCCACTCCCTCAGTCATCCCACCGGAGAATTCCACCGCCACTAACCACATAATCCGATTTCTCCAATACAAGAAGGCTCAGGAACTTAGGGAGTACCTCGAGCGCCAAGTTAAATCCAGCGGCTGGCAATGGGTCGAGCGGCGCAACCCCGCCACGAAGTTCCCCACGGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797996.1
MSRRLTSLTAFIFLVLSYHAYRFPNRNPTSTPSVIPPENSTATNHIIRFLQYKKAQELREYLERQVKSSGWQWVERRNPATKFPTDFALVTIEDRRRDFLIGEFGKLELVKDVSLDLSYQRGVLNADEEGGGAGAFSDGKKRPGKIFTAMSFSERENAVPANSSWRRNLMMQKSQVTSLFGADALWSKGYTGAKVKMAIFDTGIRANHPHFRNIKERTNWTNEDTLNDNLGHGTFVAGVIAGQDAECLGFAPDTEIYAFR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器