当前解析结果
SmilChr03G002111| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002111 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002111 |
| 描述 | ADP,ATP carrier protein 1, mitochondrial-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 32855774 - 32858963 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014073 |
|---|---|
| GeneID | 131014073 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014073 |
| 原始查询 | SmilChr03G002111 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ADP,ATP carrier protein 1, mitochondrial-like |
| 产物 | ADP%2CATP carrier protein 1%2C mitochondrial-like |
| Arabidopsis | AT5G13490 (AAC2)ADP/ATP carrier 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831193] identity=80.1; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os02g0718900 (ant)- identity=77.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0005471 (ATP:ADP antiporter activity); GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0140021 (mitochondrial ADP transmembrane transport); GO:1990544 (mitochondrial ATP transmembrane transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00153 (Mito_carr) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014073 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057797977.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057797977.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057797977.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057797977.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797977.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:32856836 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B91,B95,B98,C50 |
Chr3:32857316 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:32857518 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C64,C66 |
Chr3:32857534 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B17,B21,C28,C74 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057797977.1PF00153
Mito_carr 88-183 aa
PF00153
Mito_carr 191-285 aa
PF00153
Mito_carr 291-380 aa
XP_057797978.1PF00153
Mito_carr 88-183 aa
PF00153
Mito_carr 191-285 aa
PF00153
Mito_carr 291-380 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057797977.1 |
Pfam | PF00153 |
Mito_carr | Repeat | 88 | 183 | 2e-68 | 226.9 | Mitochondrial carrier protein |
XP_057797977.1 |
Pfam | PF00153 |
Mito_carr | Repeat | 191 | 285 | 2e-68 | 226.9 | Mitochondrial carrier protein |
XP_057797977.1 |
Pfam | PF00153 |
Mito_carr | Repeat | 291 | 380 | 2e-68 | 226.9 | Mitochondrial carrier protein |
XP_057797978.1 |
Pfam | PF00153 |
Mito_carr | Repeat | 88 | 183 | 2e-68 | 226.9 | Mitochondrial carrier protein |
XP_057797978.1 |
Pfam | PF00153 |
Mito_carr | Repeat | 191 | 285 | 2e-68 | 226.9 | Mitochondrial carrier protein |
XP_057797978.1 |
Pfam | PF00153 |
Mito_carr | Repeat | 291 | 380 | 2e-68 | 226.9 | Mitochondrial carrier protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。