当前解析结果
SmilChr03G002115| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002115 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002115 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002115 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 32904396 - 32905286 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018670 |
|---|---|
| GeneID | 131018670 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018670 |
| 原始查询 | SmilChr03G002115 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018670 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803367.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057803367.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057803367.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803367.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803367.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:32904421 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C64,C66 |
Chr3:32904444 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B123,B44,D2 |
Chr3:32904445 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | B47,B85,B9,C33,C58,C85,D1 |
Chr3:32904450 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C59 |
Chr3:32904459 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B113,C70 |
Chr3:32904459 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B113,C70 |
Chr3:32904464 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B21,B31 |
Chr3:32904483 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr3:32904487 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B20 |
Chr3:32904487 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B20 |
Chr3:32904494 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B21,B31,C17 |
Chr3:32904501 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。