当前解析结果
SmilChr03G002116| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002116 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002116 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002116 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 32915966 - 32916445 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018671 |
|---|---|
| GeneID | 131018671 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018671 |
| 原始查询 | SmilChr03G002116 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018671 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803368.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057803368.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803368.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803368.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803368.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:32915968 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B15,B64,D5,D9 |
Chr3:32915996 |
AGG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 45 | A1,A10,A11,A3,A9,B101,B105,B108,B122,B123,B138,B19,B23,B26,B40,B44,B59,B69,B70,B75,B78,B80,B85,B9,B94,C17,C21,C30,C31,C37,C41,C44,C45,C46,C49,C53,C67,C72,C74,C8,C82,C84,C9,D6,D7 |
Chr3:32916000 |
G |
GAA |
2bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 45 | A1,A10,A11,A3,A9,B101,B105,B108,B122,B123,B138,B19,B23,B26,B40,B44,B59,B69,B70,B75,B78,B80,B85,B9,B94,C17,C21,C30,C31,C37,C41,C44,C45,C46,C49,C53,C67,C72,C74,C8,C82,C84,C9,D6,D7 |
Chr3:32916008 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr3:32916011 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr3:32916022 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B55,C1 |
Chr3:32916025 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B3,C41 |
Chr3:32916025 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B3,C41 |
Chr3:32916038 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,C5,C73,C82 |
Chr3:32916061 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,B21,B47,C56,C78 |
Chr3:32916072 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B55,C1 |
Chr3:32916085 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B3,C41 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。