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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002152`

染色体: Chr03 坐标: 33470960-33473313 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002152`
名称	SmilChr03G002152
描述	DUF724 domain-containing protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	33470960 - 33473313 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019196`
GeneID	`131019196`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019196`
原始查询	`SmilChr03G002152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF724 domain-containing protein 2-like
产物	DUF724 domain-containing protein 2-like
Arabidopsis	`AT1G11420` (DUF2) at domain protein (DOMAIN OF UNKNOWN FUNCTION 724 2) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837684] identity=26.9; qcov=0.955; evalue=5.88e-48; confidence=low
Rice	`Os11g0552100` - identity=31.5; qcov=0.268; evalue=1.38e-21; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05266 (DUF724); PF05641 (Agenet)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019196

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803854.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803854.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803854.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803854.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803854.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:33471228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C62
`Chr3:33471249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C36
`Chr3:33471291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B53,C73
`Chr3:33471415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:33471457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B72,B77,C51
`Chr3:33471693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B15
`Chr3:33471693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr3:33471753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B123,B46
`Chr3:33471797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,D10
`Chr3:33471810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:33471829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr3:33472106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803854.1

616 aa

308

616

Agenet

DUF724

PF05641 Agenet 25-96 aa PF05641 Agenet 182-233 aa PF05266 DUF724 433-607 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803854.1`	Pfam	`PF05641`	Agenet	Domain	25	96	1.1e-26	93.8	Agenet domain
`XP_057803854.1`	Pfam	`PF05641`	Agenet	Domain	182	233	1.1e-26	93.8	Agenet domain
`XP_057803854.1`	Pfam	`PF05266`	DUF724	Family	433	607	1.1e-43	150.1	Protein of unknown function (DUF724)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947871.1
TTCCACGACATTAATCTATGGGAAATCGAGATTCTCTTTGCTGTTTATTGGTGGCGCTGCCCCTCACGCTAATTATGCCAACAGGGTACAGTCCTAGAAGTAAATGCAGAAATTGTACGCACAAATCACCTCAAATTTTATTATAAAGTTTTCTGCATGCTATGCAATGATGGAAAAAAGTGTAAGACGGGAAGTTGAAAAGACTTGGTTTTACGAAATCCAAACCCACACACTTGAAACTTCACTCCACAAAAGGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019196
ATGGGCGCCGATGATGTAGAAAAACCCCAAATCCCACCCATCAACGACCGCGACGGCCACCAGTTCCCGGTGGGTTCTCTCGTGGAAGTATATGTCAACGAGGAAAACATGGGAGACGTCTATTTTTCCGCCACCGTGGTCCCGCCGCCACACTCTCCCAGAAAAAGCAACACCCAAATTTCCGGGGAAAAGCTATACGTCAAGTACGAAAATCTCCTGGCCCGCAAAAACAGGCCGGATCGGCTGCGCGAGTGCGTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803854.1
MGADDVEKPQIPPINDRDGHQFPVGSLVEVYVNEENMGDVYFSATVVPPPHSPRKSNTQISGEKLYVKYENLLARKNRPDRLRECVDISIVRPAPPLLQKAAAKRFEPNDVVDAFYNDGWWKGVISSVVGGGERFVVTFENPPDVQEFGPTALRAHWDWADGVWTGLVERKGKMGISAFETGAEVEISLEDAWFPAAIVRDLGNGAYLVEMKDKNGEMVEAQVDFGHIRPCPPIFRERKFGIWEKVDAFFDYGWRSGLIK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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