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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002157`

染色体: Chr03 坐标: 33566471-33574270 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002157`
名称	SmilChr03G002157
描述	KH domain-containing protein At3g08620-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	33566471 - 33574270 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015817`
GeneID	`131015817`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015817`
原始查询	`SmilChr03G002157`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	KH domain-containing protein At3g08620-like
产物	KH domain-containing protein At3g08620-like
Arabidopsis	`AT2G38610` (AT2G38610) RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818443] identity=78.5; qcov=1.06; evalue=2.49e-131; confidence=high
Rice	`Os07g0227400` - identity=68.9; qcov=1.06; evalue=2.18e-115; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0048024 (regulation of mRNA splicing, via spliceosome)
KEGG	-
Pfam	PF16544 (STAR_dimer); PF22675 (KH-I_KHDC4-BBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015817

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800222.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057800222.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057800224.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057800222.1`
5	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057800225.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:33567149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:33567855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800222.1

273 aa

136

273

STAR_dimer

KH-I_KHDC4-BBP

PF16544 STAR_dimer 28-74 aa PF22675 KH-I_KHDC4-BBP 133-223 aa

XP_057800224.1

271 aa

136

271

STAR_dimer

KH-I_KHDC4-BBP

PF16544 STAR_dimer 28-74 aa PF22675 KH-I_KHDC4-BBP 133-221 aa

XP_057800225.1

228 aa

114

228

KH-I_KHDC4-BBP

PF22675 KH-I_KHDC4-BBP 88-178 aa

XP_057800226.1

228 aa

114

228

KH-I_KHDC4-BBP

PF22675 KH-I_KHDC4-BBP 88-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800222.1`	Pfam	`PF16544`	STAR_dimer	Domain	28	74	1.5e-13	50.7	Homodimerisation region of STAR domain protein
`XP_057800222.1`	Pfam	`PF22675`	KH-I_KHDC4-BBP	Domain	133	223	6.2e-22	78.0	KHDC4/BBP-like, KH-domain type I
`XP_057800224.1`	Pfam	`PF16544`	STAR_dimer	Domain	28	74	1.5e-13	50.7	Homodimerisation region of STAR domain protein
`XP_057800224.1`	Pfam	`PF22675`	KH-I_KHDC4-BBP	Domain	133	221	2.7e-22	79.1	KHDC4/BBP-like, KH-domain type I
`XP_057800225.1`	Pfam	`PF22675`	KH-I_KHDC4-BBP	Domain	88	178	4e-22	78.6	KHDC4/BBP-like, KH-domain type I
`XP_057800226.1`	Pfam	`PF22675`	KH-I_KHDC4-BBP	Domain	88	178	4e-22	78.6	KHDC4/BBP-like, KH-domain type I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944241.1
GTGGCTATTTCTTTTCCATTTCTCTGCGTAAACCAAACCAGCACTTAGTTTGTTGGTCGTTTGACGATGATTGATAACTGGCTTAAAACGTCGGCGTATGGTAGAAGGTAGGGGCAGCCTGTCAGTCCAGCTAAGACTGGGTTGGCAAATACCAATACAGCATCGGCATCGCAATGAAATTGCTCCAACACGTGGTGCCAAATGCCAGTGCCCACCGCCACCAACACTGAAATACCTTTCCAATTTTTGCAAACCTGCAC...

XM_057944239.1
GTGGCTATTTCTTTTCCATTTCTCTGCGTAAACCAAACCAGCACTTAGTTTGTTGGTCGTTTGACGATGATTGATAACTGGCTTAAAACGTCGGCGTATGGTAGAAGGTAGGGGCAGCCTGTCAGTCCAGCTAAGACTGGGTTGGCAAATACCAATACAGCATCGGCATCGCAATGAAATTGCTCCAACACGTGGTGCCAAATGCCAGTGCCCACCGCCACCAACACTGAAATACCTTTCCAATTTTTGCAAACCTGCAC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131015817
ATGTCGGGTCTTTACAATTCCAACTTCTCGCCCGCGCGGGCAGCCTCTCCACAGATTTCTACAACTCCCCATGATATAGATAGTAATCAGTATTTATCAGAGCTGTTGGCGGAGCATCAAAAACTTGTACCTTTCATGCAGATTCTCCCCATCTCTACAAAACTCTTGAATCAAGAGATATTGCGGGTTACGGGGATGATGCCAAATCACAACTTCAGTGAACTTGAGAGACTAAGACATAGAAGTCCCAGCCCTATGGC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057800222.1
MSGLYNSNFSPARAASPQISTTPHDIDSNQYLSELLAEHQKLVPFMQILPISTKLLNQEILRVTGMMPNHNFSELERLRHRSPSPMASTSWNGLTQERLGGPHGMTMDWLGAPASPSSYTVKRILRLEIPVDNYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEATTGCRVFIRGKGSIKDPDKLQEEKLRGRPGYEHLNEPLHILIEADLPANVVDMRLRQAQEIIEELLKPVDESQDFIKRQQLRELAMLNSNFREESPGPSGSVSP...

XP_057800224.1
MSGLYNSNFSPARAASPQISTTPHDIDSNQYLSELLAEHQKLVPFMQILPISTKLLNQEILRVTGMMPNHNFSELERLRHRSPSPMASTSWNGLTQERLGGPHGMTMDWLGAPASPSSYTVKRILRLEIPVDNYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEATTGCRVFIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLNEPLHILIEADLPANVVDMRLRQAQEIIEELLKPVDESQDFIKRQQLRELAMLNSNFREESPGPSGSVSPFN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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