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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002158`

染色体: Chr03 坐标: 33606072-33607171 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002158`
名称	SmilChr03G002158
描述	uncharacterized SmilChr03G002158
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	33606072 - 33607171 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018681`
GeneID	`131018681`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018681`
原始查询	`SmilChr03G002158`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018681

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803377.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803377.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803377.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057803377.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803377.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:33606075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr3:33606076`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A14
`Chr3:33606076`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A14
`Chr3:33606086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B34,B4,B99
`Chr3:33606092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B34,B4,B99
`Chr3:33606113`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C58
`Chr3:33606113`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C58
`Chr3:33606119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr3:33606136`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	52	A13,A20,A4,B105,B106,B11,B114,B120,B121,B132,B17,B20,B34,B38,B39,B4,B42,B43,B51,B56,B58,B59,B60,B61,B69,B74,B82,B86,B90,B91,B92,B96,C1,C13,C15,C16,C24,C29,C36,C39,C40,C52,C54,C57,C58,C59,C65,C8,C82,C9,D5,D7
`Chr3:33606139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:33606151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A2,C12,D6
`Chr3:33606151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C12,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803377.1

300 aa

150

300

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 95-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803377.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	95	158	4e-11	43.8	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947394.1
ATGGAGGTATTGAGGATGTTGGGGACACTTCCAGTCAAACCAGACCTGTCACAGAACGACGGGAGAGCGGCCCAGCACTGGAGGATCCAGTCCAGCTGGGTCTCAGCTATGCAGCGACACCTCCAAGAATTGGATAAAGTAATTGAGGAAAAAGAGAAGGAAAAAAGTAAGGTTGTCTCGCAAAAAAGGGGACGGTATGAGGACTCTACCCATCCCAGGGCTGAAAGTCACCGGGATAGACATGTTCATCTGAGGGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018681
ATGGAGGTATTGAGGATGTTGGGGACACTTCCAGTCAAACCAGACCTGTCACAGAACGACGGGAGAGCGGCCCAGCACTGGAGGATCCAGTCCAGCTGGGTCTCAGCTATGCAGCGACACCTCCAAGAATTGGATAAAGTAATTGAGGAAAAAGAGAAGGAAAAAAGTAAGGTTGTCTCGCAAAAAAGGGGACGGTATGAGGACTCTACCCATCCCAGGGCTGAAAGTCACCGGGATAGACATGTTCATCTGAGGGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803377.1
MEVLRMLGTLPVKPDLSQNDGRAAQHWRIQSSWVSAMQRHLQELDKVIEEKEKEKSKVVSQKRGRYEDSTHPRAESHRDRHVHLREKNKQNSRAGENDPKVHMAKFETVITLHQYTKGIKCKIFSTTLTGIAQQWFRALEPDSIHSFEQLHDAFMCQYASSERAAKTAMSLMDLKQEPTETLKEFAAHFTNASLEVPKAKSQIKGYAFVRGLRPAAFFDNLQLKEARAARKIEYSGNKPKKVENKAKTSDTRPQGRALYR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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