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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002167`

染色体: Chr03 坐标: 33707549-33713253 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002167`
名称	SmilChr03G002167
描述	uncharacterized SmilChr03G002167
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	33707549 - 33713253 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016401`
GeneID	`131016401`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016401`
原始查询	`SmilChr03G002167`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016401

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801082.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057801082.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057801082.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801082.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801082.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:33709077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr3:33709078`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C33
`Chr3:33709078`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C33
`Chr3:33709089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B34,B4,B99
`Chr3:33709120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr3:33709191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B133,B42,B43,B90,B92
`Chr3:33709191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B42,B43,B90,B92
`Chr3:33709215`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A8,B110,B113,B137,B16,B2,B64,B68,B72,B77,B78,B84,C14,C19,C20,C28,C37,C4,C51,C55,C65,C80,C84,D2,D8
`Chr3:33709231`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B25,B88
`Chr3:33709231`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B25,B88
`Chr3:33709267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B34,B4,B99
`Chr3:33709285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B131,B34,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801082.1

281 aa

140

281

DUF8566

PF29561 DUF8566 109-281 aa

XP_057801083.1

281 aa

140

281

DUF8566

PF29561 DUF8566 109-281 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801082.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	109	281	1.4e-37	130.2	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057801083.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	109	281	1.4e-37	130.2	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098978.1
AAGGTCACTTTTTGTCCCATCGTTTTAGCGAATTCTCAAAAATGTCCCAACCTAACGATAATACCAAAACGATACCCAACCTATCACAAAAATATCATCCGTGTCCTATTAAAATTTTCCGACAATCGGAAAATGACGTGGATAGCCGGAGTTACGACGTGGCATGCCTATGTGGACCGAAAAGAAAAAATGAAAGAACTAAAATATACATAATTTAAAATGCCATCATTTAAAATTAGTAAAAGAAAAAAGAAAAAAAA...

XM_057945099.1
ATCGTTTTAGCGAATTCTCAAAAATGTCCCAACCTAACGATAATACCAAAACGATACCCAACCTATCACAAAAATATCATCCGTGTCCTATTAAAATTTTCCGACAATCGGAAAATGACGTGGATAGCCGGAGTTACGACGTGGCATGCCTATGTGGACCGAAAAGAAAAAATGAAAGAACTAAAATATACATAATTTAAAATGCCATCATTTAAAATTAGTAAAAGAAAAAAGAAAAAAAATTAAAACACAATTTATGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016401
ATGGATCGGCAAAAAGATAAAGATGCTGTTACAAACAATTTCCTTTTGCCGGACAGGAAGCGGACAAAGATTACATGTCCGGACATTTCTTTCAGCGATAAAGGAAAGTCGAAAGTTCCTATGTTTTCTGTTGTGCATGGTTCATCATCTGCAGGTGTGATGAGGAGCACTAAAAATGACAACTTCGATGCAGTTCCAAGGAAATATTCAAATAATGTTGTGGACTTAACAACTCCACATGTCATTCAAATATCTGGAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801082.1
MDRQKDKDAVTNNFLLPDRKRTKITCPDISFSDKGKSKVPMFSVVHGSSSAGVMRSTKNDNFDAVPRKYSNNVVDLTTPHVIQISGDRFTQEVTKVYSRRRQKGPTLNTRTTPASFHDALLKLNNAQISAGREIGFGRILELKVKDLPLRLAYWVHNKFNADTCELEVDARRRFAVTPVDVYRVFGFPSGDKSIEIFERQSNSDLFEQWVSIFGVDSRDKIKIGVVIKEMLDCKCGGSWFKRHFMIAMSFSLFESYANGT...

XP_057801083.1
MDRQKDKDAVTNNFLLPDRKRTKITCPDISFSDKGKSKVPMFSVVHGSSSAGVMRSTKNDNFDAVPRKYSNNVVDLTTPHVIQISGDRFTQEVTKVYSRRRQKGPTLNTRTTPASFHDALLKLNNAQISAGREIGFGRILELKVKDLPLRLAYWVHNKFNADTCELEVDARRRFAVTPVDVYRVFGFPSGDKSIEIFERQSNSDLFEQWVSIFGVDSRDKIKIGVVIKEMLDCKCGGSWFKRHFMIAMSFSLFESYANGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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