当前解析结果
SmilChr03G002180| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002180 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002180 |
| 描述 | high mobility group B protein 6-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 33889388 - 33890394 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016413 |
|---|---|
| GeneID | 131016413 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016413 |
| 原始查询 | SmilChr03G002180 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | high mobility group B protein 6-like |
| 产物 | high mobility group B protein 6-like |
| Arabidopsis | AT5G01910 (AT5G01910)myelin transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831775] identity=42.9; qcov=0.923; evalue=7.38e-29; confidence=medium |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016413 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801094.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057801094.1 |
| 3 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.40000 | XP_057801094.1 |
| 4 | Spindle | Spindle | 0.40000 | XP_057801094.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.20000 | XP_057801094.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:33889625 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A9,B112,B82 |
Chr3:33889665 |
TGC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B59,B9,B98 |
Chr3:33889665 |
TGC |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | B59,B9,B98 |
Chr3:33889778 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B15 |
Chr3:33889785 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr3:33889806 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B68,C62 |
Chr3:33889828 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,B24,D9 |
Chr3:33889836 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B11,C58 |
Chr3:33889837 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B11,C58 |
Chr3:33889935 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:33889953 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr3:33889962 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B14,B87,C60,C82,D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。