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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002181`

染色体: Chr03 坐标: 33890790-33894444 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002181`
名称	SmilChr03G002181
描述	vacuolar-sorting receptor 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	33890790 - 33894444 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016414`
GeneID	`131016414`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016414`
原始查询	`SmilChr03G002181`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar-sorting receptor 1-like
产物	vacuolar-sorting receptor 1-like
Arabidopsis	`AT2G30290` (VSR2) VACUOLAR SORTING RECEPTOR 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817579] identity=71.4; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0116550` - identity=76.4; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF02225 (PA); PF25011 (VSR_TRX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016414

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057801095.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057801095.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057801095.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057801095.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801095.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:33891347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B63,B83
`Chr3:33891350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B63,B83
`Chr3:33891356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B9,B98
`Chr3:33891693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B29,C16
`Chr3:33891702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:33891756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B63,B83
`Chr3:33891780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C20
`Chr3:33891876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C62
`Chr3:33891906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr3:33892011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr3:33892074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B136,B52,C54
`Chr3:33892323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801095.1

626 aa

313

626

VSR_TRX

PF02225 PA 63-162 aa PF25011 VSR_TRX 189-396 aa

XP_057801096.1

626 aa

313

626

VSR_TRX

PF02225 PA 63-162 aa PF25011 VSR_TRX 189-396 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801095.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	63	162	1.6e-12	48.1	PA domain
`XP_057801095.1`	Pfam	`PF25011`	VSR_TRX	Domain	189	396	9.6e-104	346.3	Vacuolar sorting receptor thioredoxin-like domain
`XP_057801096.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	63	162	1.6e-12	48.1	PA domain
`XP_057801096.1`	Pfam	`PF25011`	VSR_TRX	Domain	189	396	9.6e-104	346.3	Vacuolar sorting receptor thioredoxin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098985.1
GCTGTGTTGTAGACTTGACCAACCAACCATTCCCGATTTAGACTTGATCAACTAACTGCGCTTTCTTAGATCTCTATGCTTACTGTTTTTACGCTCCTAAATTAGTGTCTTTACAGCTGATAAACAAAAAATAACAAAAATGGTAGTTTCTGAACTCATGGAGTTGTAATTTACGTCAAACACTTTGAGATTTTACATTCATGCCTGAAGCATATAATCAAAACATATGAATCTTATCTTCCTCATCTGTTTCTCTTGTT...

XR_009098986.1
GCTGTGTTGTAGACTTGACCAACCAACCATTCCCGATTTAGACTTGATCAACTAACTGCGCTTTCTTAGATCTCTATGCTTACTGTTTTTACGCTCCTAAATTAGTGTCTTTACAGCTGATAAACAAAAAATAACAAAAATGGTAGTTTCTGAACTCATGGAGTTGTAATTTACGTCAAACACTTTGAGATTTTACATTCATGCCTGAAGCATATAATCAAAACATATGAATCTTATCTTCCTCATCTGTTTCTCTTGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016414
ATGAGAGAAAAGCTGAGCGTTTTTGCGTGGGTGTGTGTGTTAATGTTTGGATCAATTTGTTGGGGAAGGTTCGTTGTGGAGAAGAACAATTTGAAGGTGACATCTCCAGAGTCGGTGAAAGGCGTTTATGAATGTGCAATAGGAAATTTTGGTGTACCTCAATATGGAGGAACAATGGTTGGCTCTATATTCTACCCCAAATCCAATAAAAAGGGCTGCAAACCTTTCAAAGATGCCGACGTGTCATGGAAGAATAAGCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801095.1
MREKLSVFAWVCVLMFGSICWGRFVVEKNNLKVTSPESVKGVYECAIGNFGVPQYGGTMVGSIFYPKSNKKGCKPFKDADVSWKNKPGGIPVFLLADRGECYFTLKAWNAQNAGVAAILVADDRVEPLITMDTPEDGDTQPDYLQNISIPSALISKGLGDRIKKVLAKGELVSINLDWREALPHPDERVEYEFWTNSNDECGPKCESQLNFLRNFKGAAQILEQKGYTEFTPHYITWYCPEAFIMSQQCKSQCINYGRYC...

XP_057801096.1
MREKLSVFAWVCVLMFGSICWGRFVVEKNNLKVTSPESVKGVYECAIGNFGVPQYGGTMVGSIFYPKSNKKGCKPFKDADVSWKNKPGGIPVFLLADRGECYFTLKAWNAQNAGVAAILVADDRVEPLITMDTPEDGDTQPDYLQNISIPSALISKGLGDRIKKVLAKGELVSINLDWREALPHPDERVEYEFWTNSNDECGPKCESQLNFLRNFKGAAQILEQKGYTEFTPHYITWYCPEAFIMSQQCKSQCINYGRYC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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