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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002182`

染色体: Chr03 坐标: 33894567-33895348 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002182`
名称	SmilChr03G002182
描述	RING-H2 finger protein ATL74-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	33894567 - 33895348 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016416`
GeneID	`131016416`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016416`
原始查询	`SmilChr03G002182`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL74-like
产物	RING-H2 finger protein ATL74-like
Arabidopsis	`AT3G10910` (AT3G10910) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820261] identity=49.1; qcov=0.919; evalue=7.21e-43; confidence=medium
Rice	`Os11g0116200` (OsLTP1.13) - identity=50.4; qcov=0.757; evalue=1.1e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016416

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057801097.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057801097.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057801097.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057801097.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057801097.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:33894791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B117,C3
`Chr3:33894794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B9,B98
`Chr3:33894951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:33895045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:33895097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B112,B82
`Chr3:33895099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B117,B35,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801097.1

173 aa

173

zf-RING_2

zf-RING_11

zf-C3HC4_2

zf-C3HC4

PF13639 zf-RING_2 100-144 aa PF17123 zf-RING_11 101-130 aa PF13923 zf-C3HC4_2 101-143 aa PF00097 zf-C3HC4 102-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801097.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	100	144	3.1e-15	56.9	Ring finger domain
`XP_057801097.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	101	130	1.7e-11	44.3	RING-like zinc finger
`XP_057801097.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	101	143	4e-09	36.9	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057801097.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	102	143	1.1e-06	29.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945114.1
TCAAGATTTGGTAGCTTTACCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATAGAAGACGGTGCAAACAACTTTGGCTCTACTCCCGTTTTAAAACACCGTTTTCCTGAATGGAGCTGGAGTATCTGCGGCGGCCAGTAATTTTCCTCCGCCGGCTACTAACCGATAACGAAACCGAGTCAAACGATTCCTACGGCGGCGATGACTCAGAGTTGGACACAAACATGGTCATAATCCTAGCTTTTTTGCTCTGCGCGTTGCTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016416
ATGGAGCTGGAGTATCTGCGGCGGCCAGTAATTTTCCTCCGCCGGCTACTAACCGATAACGAAACCGAGTCAAACGATTCCTACGGCGGCGATGACTCAGAGTTGGACACAAACATGGTCATAATCCTAGCTTTTTTGCTCTGCGCGTTGCTCTTCACACTCGGGCTCAACGCATTCGCGCGCAGTGGTTTACTCAACGTATTTAGCAGCTCGCCGGCGGCGGCGCCGGGCCTCAAGAAGCGCGCCCTGCGCCACCTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801097.1
MELEYLRRPVIFLRRLLTDNETESNDSYGGDDSELDTNMVIILAFLLCALLFTLGLNAFARSGLLNVFSSSPAAAPGLKKRALRHLPVAVYGSGPDVSGNECPICLGDFVEGERIRVLPKCGHGFHVGCIDTWLVAHASCPNCRISLLEAPPPSSTAAESDEPQLPVVISTQP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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