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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002191`

染色体: Chr03 坐标: 34398878-34408496 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002191`
名称	SmilChr03G002191
描述	uncharacterized SmilChr03G002191
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	34398878 - 34408496 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018693`
GeneID	`131018693`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018693`
原始查询	`SmilChr03G002191`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=27.4; qcov=0.331; evalue=2.07e-43; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=26.2; qcov=0.636; evalue=5.51e-66; confidence=low
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF05970 (PIF1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018693

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803390.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803390.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803390.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803390.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803390.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:34398886`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A2,A25,A7,B1,B107,B122,B124,B128,B24,B27,B36,B39,B4,B45,B5,B64,B99,C10,C18,C24,C28,C30,C49,C51,C57,C76,C77,C78,C87,D2,D4,D5
`Chr3:34398899`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	B106,B108,B111,B23,B3,B31,B37,B51,B60,B70,C21,C48,C60,C63,C64,C66,C67
`Chr3:34398916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,B80
`Chr3:34398922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B33
`Chr3:34398943`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B81
`Chr3:34398943`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B81
`Chr3:34398951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,D7
`Chr3:34398955`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B81
`Chr3:34398955`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B81
`Chr3:34398970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B99,C26
`Chr3:34398974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr3:34398987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803390.1

1302 aa

651

1302

PIF1

RVT_1

zf-RVT

PF05970 PIF1 1-105 aa PF00078 RVT_1 660-775 aa PF13966 zf-RVT 1104-1198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803390.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	1	105	7.7e-41	140.8	PIF1-like helicase
`XP_057803390.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	660	775	1.2e-19	71.7	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057803390.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	1104	1198	9.2e-20	71.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947407.1
ATGACACATAGATACTGTTTTGAAGCGCTTGATAGAAGCCTAAGGGATATTATGAGATCTTCCGATAGGTCTGGAAAACCTTTTGGAGGTTTGGTGGTTGTTTTAGGAGGCGACTTTCGACAGATACTTCCAGTGATCCCTAAGGGAAGTCGGCATGACATCGTGCATGCCTCTATAAGTTCATCTCAACTTTGGAATTCGTGTCAAGTTCTCAAGTTAACTAAGAACATGAGATTACAGGCAAATGCTTCTGGTTCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018693
ATGACACATAGATACTGTTTTGAAGCGCTTGATAGAAGCCTAAGGGATATTATGAGATCTTCCGATAGGTCTGGAAAACCTTTTGGAGGTTTGGTGGTTGTTTTAGGAGGCGACTTTCGACAGATACTTCCAGTGATCCCTAAGGGAAGTCGGCATGACATCGTGCATGCCTCTATAAGTTCATCTCAACTTTGGAATTCGTGTCAAGTTCTCAAGTTAACTAAGAACATGAGATTACAGGCAAATGCTTCTGGTTCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803390.1
MTHRYCFEALDRSLRDIMRSSDRSGKPFGGLVVVLGGDFRQILPVIPKGSRHDIVHASISSSQLWNSCQVLKLTKNMRLQANASGSDAEETKEFAEWMLKIGDGTAGYSLGDGESVVALSEDILIRDATNPIAAIVDNTYNDVMNNAILAPTNEMVDTINNYVMSLMSSKERVYLSSDNICKEDGQVDLDEQETKLECWNDATHLNWWGRGISELMGRDAEGRSGGIICAWNKEVFTASSKWDIPGAVIINGKWISSNSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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