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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002200`

染色体: Chr03 坐标: 34600775-34607949 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002200`
名称	SmilChr03G002200
描述	protein SCAR2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	34600775 - 34607949 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016428`
GeneID	`131016428`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016428`
原始查询	`SmilChr03G002200`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SCAR2-like
产物	protein SCAR2-like
Arabidopsis	`AT2G38440` (SCAR2) SCAR homolog 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818425] identity=39.2; qcov=0.276; evalue=5.66e-49; confidence=weak
Rice	`Os03g0817000` (OsSCAR3) - identity=45.7; qcov=0.114; evalue=2.43e-23; confidence=weak
GO	GO:0003779 (actin binding); GO:0005856 (cytoskeleton); GO:0030036 (actin cytoskeleton organization); GO:0034237 (protein kinase A regulatory subunit binding); GO:0071933 (Arp2/3 complex binding); GO:2000601 (positive regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation)
KEGG	-
Pfam	PF27569 (SCAR_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016428

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801103.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801104.1`
3	Endosome	内体	0.20000	`XP_057801103.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801104.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801103.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:34600915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C28
`Chr3:34603337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:34603473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:34603490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr3:34603868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr3:34603899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr3:34603956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:34603962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:34604400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C28
`Chr3:34604401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B72,D10
`Chr3:34604486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B114,B25,B88
`Chr3:34604500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801103.1

1458 aa

729

1458

SCAR_helical

PF27569 SCAR_helical 4-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801103.1`	Pfam	`PF27569`	SCAR_helical	Domain	4	189	3.1e-71	239.7	SCAR helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945120.1
GAATAGTTTCTTGTCTGCTATTAGTCAAAACACAAGTCCGCTCCGCCCACCACTCTCTTTCACAGTTGCCAAATTGATGAATCGAAATTCCGTTGGATTTGATTTTTCGGCGTCGAAACTGCAGAAATGCCGATGAATCGCTACGAGATACGGGACGAGTACAGCTTGGCCGATCCGGAGCTGTATCGAGCCGCCGACAAGGATGATCCCGAGGCCTTGCTTGAAGGCGTCGCCATGGCTGGCATGGTCGGCGTCCTTCG...

XM_057945121.1
GCAGAGATTTTTCATGATTTACATGAAGAAGTGATGGCTACCGCTGTGAGAGGACACAGTTTAAAGATACGAGTCCAACAGCTGGAGGCTGAAGTTCCTTCCGTTGAAAAGGTGTTGACTGGCATGCTAACCTACAATTGGACCAGAATCTGGTCACACAAGGAGATTTGCCTCGTTTTGTTATGGACTCCTATGAAGAATGCAGGGGTCCTCCTCGACTATTTCTTTTAGACAAGTTTGATGTTGCTGGTGCTGGAGCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016428
ATGCCGATGAATCGCTACGAGATACGGGACGAGTACAGCTTGGCCGATCCGGAGCTGTATCGAGCCGCCGACAAGGATGATCCCGAGGCCTTGCTTGAAGGCGTCGCCATGGCTGGCATGGTCGGCGTCCTTCGCCAGCTCGGAGACCTCGCCGAGTTTGCAGCAGAGATTTTTCATGATTTACATGAAGAAGTGATGGCTACCGCTGTGAGAGGACACAGTTTAAAGATACGAGTCCAACAGCTGGAGGCTGAAGTTCC...

LOC131016428
ATGGACTCCTATGAAGAATGCAGGGGTCCTCCTCGACTATTTCTTTTAGACAAGTTTGATGTTGCTGGTGCTGGAGCATCTCTAAAACGCTACACTGATCCTTCATTCTTTAAAGTAGAGACCTCTGCACCAGCTAATGCAAATGTCCAAAGGGAAAAGAAGATCAGGAAAGCAAAGAAGAAAGGACCACGTGCGAGATATGGAGGAACACCTGAAACTTTGCAAGCATCATCCCATGCGAAACTCCATCAGCTTTTACT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801103.1
MPMNRYEIRDEYSLADPELYRAADKDDPEALLEGVAMAGMVGVLRQLGDLAEFAAEIFHDLHEEVMATAVRGHSLKIRVQQLEAEVPSVEKALLSQTDLSSVFYNAGVDWHANLQLDQNLVTQGDLPRFVMDSYEECRGPPRLFLLDKFDVAGAGASLKRYTDPSFFKVETSAPANANVQREKKIRKAKKKGPRARYGGTPETLQASSHAKLHQLLLEECVENGVTKPAYRARLKRRPNAFPFNSKSGKSYMEELLKNPS...

XP_057801104.1
MDSYEECRGPPRLFLLDKFDVAGAGASLKRYTDPSFFKVETSAPANANVQREKKIRKAKKKGPRARYGGTPETLQASSHAKLHQLLLEECVENGVTKPAYRARLKRRPNAFPFNSKSGKSYMEELLKNPSPEHNLLHEITVSSPLQMSIDDQNESVLKLRSVGSAIESEGSKSNPPFADREEIMPNPSSNQRNDASTDIKTYGVSSLLNILTDDIPSTSDEENSRKDIAVDGESKLEGSLIGYQSDGVASEIDNYVDAPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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